More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4344 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  62.68 
 
 
148 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  63.83 
 
 
148 aa  191  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  63.04 
 
 
139 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  65.69 
 
 
150 aa  187  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  64.03 
 
 
139 aa  186  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  61.43 
 
 
143 aa  186  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  62.77 
 
 
165 aa  184  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  60 
 
 
144 aa  183  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  63.5 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  61.11 
 
 
148 aa  181  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  59.85 
 
 
145 aa  178  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  59.72 
 
 
146 aa  178  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  57.64 
 
 
145 aa  176  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  57.25 
 
 
154 aa  176  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  58.33 
 
 
146 aa  173  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  58.39 
 
 
145 aa  172  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  55.71 
 
 
154 aa  171  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  52.05 
 
 
146 aa  169  9e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  57.25 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  57.25 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  57.25 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  57.25 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  57.25 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  55.48 
 
 
148 aa  167  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  57.25 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  57.25 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  57.25 
 
 
150 aa  167  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  58.46 
 
 
181 aa  167  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  54.79 
 
 
148 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  54.17 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  54.17 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  54.17 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  55.07 
 
 
150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  54.74 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  54.17 
 
 
146 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  53.47 
 
 
146 aa  158  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  51.37 
 
 
148 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  51.8 
 
 
145 aa  157  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  51.45 
 
 
147 aa  156  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  55.47 
 
 
149 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  54.29 
 
 
148 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  49.64 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  51.43 
 
 
145 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  51.09 
 
 
144 aa  152  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  52.41 
 
 
146 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
147 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
147 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  51.06 
 
 
151 aa  147  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  48.55 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  49.65 
 
 
144 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  47.55 
 
 
150 aa  141  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  47.86 
 
 
150 aa  133  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
151 aa  133  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  44.52 
 
 
171 aa  133  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  44.14 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  45.99 
 
 
153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  41.55 
 
 
151 aa  127  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
149 aa  127  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  47.48 
 
 
147 aa  126  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  46.53 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  44.9 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  47.1 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  45.65 
 
 
162 aa  123  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  46.1 
 
 
146 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
156 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
155 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  45.65 
 
 
162 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  44.2 
 
 
151 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  43.07 
 
 
153 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
153 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  45.32 
 
 
145 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
153 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
153 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  42.47 
 
 
153 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  47.79 
 
 
149 aa  119  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  45.39 
 
 
146 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  46.21 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  41.73 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  41.3 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  39.86 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  40.71 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  44.6 
 
 
149 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  41.84 
 
 
160 aa  115  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  40.29 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  43.88 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  41.55 
 
 
156 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  41.43 
 
 
148 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5237  response regulator receiver protein  47.29 
 
 
136 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46611  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0517  response regulator receiver protein  42.22 
 
 
155 aa  114  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  38.41 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  41.43 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>