More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2148 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  100 
 
 		 140 aa  277  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  40.56 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  40.6 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  44.36 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  38.35 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  45.63 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  40.71 
 
 		 169 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  38.03 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  42.86 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.76 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  33.81 
 
 		 159 aa  94.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  44.66 
 
 		 518 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  39.01 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  36.76 
 
 		 238 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.78 
 
 		 163 aa  88.6  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  35.29 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  32.14 
 
 		 194 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  31.65 
 
 		 194 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  32.14 
 
 		 194 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  37.31 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.14 
 
 		 167 aa  87.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  87.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  39.47 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.61 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.06 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.06 
 
 		 159 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  36.3 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.78 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.78 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.78 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.78 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.61 
 
 		 164 aa  85.9  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  39.47 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  33.33 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.06 
 
 		 159 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  36.63 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.61 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  37.86 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  37.76 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.88 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.88 
 
 		 164 aa  84.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  42 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  42 
 
 		 165 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  35.46 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  36.43 
 
 		 167 aa  84  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.61 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.07 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.61 
 
 		 163 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  29.1 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.85 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  35.34 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.16 
 
 		 159 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  31.39 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.07 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  35.9 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  35.64 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  35.56 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  35.9 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  35.9 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.88 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.61 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.33 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  41.84 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  35.97 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  36.28 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  35.66 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.59 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  30.6 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.33 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  40 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  35.51 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  35.04 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  37.86 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  31.65 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  35.51 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  35.04 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  40.21 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.85 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  36.76 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  33.33 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  36.3 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.1 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.1 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  33.09 
 
 		 187 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.45 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  36.5 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  40.19 
 
 		 179 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  40.59 
 
 		 174 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  34.33 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  30.94 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>