More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1118 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  66.34 
 
 
103 aa  126  8e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 
103 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  61.39 
 
 
103 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 
104 aa  117  4e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.35569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  56.44 
 
 
104 aa  115  2e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  56.44 
 
 
132 aa  114  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.0004e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  57.43 
 
 
102 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 
104 aa  112  1e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  54.46 
 
 
105 aa  112  1e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  53.92 
 
 
103 aa  113  1e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  57.43 
 
 
103 aa  112  2e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 
103 aa  111  4e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
104 aa  110  7e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  56.44 
 
 
102 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.83343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 
104 aa  107  8e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 
103 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
104 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  53.47 
 
 
114 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  103  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  5.64167e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
105 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
102 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  57.84 
 
 
102 aa  101  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  5.99107e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  52.94 
 
 
102 aa  100  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  43.14 
 
 
103 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 
102 aa  100  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.07252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  52.94 
 
 
104 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.43983e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  5.79103e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
102 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  96.7  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  50.47 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.52 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3033  ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  5.83134e-08  unclonable  1.78409e-08 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  94.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  94.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  94.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.032e-07  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  6.19372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.05057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  94  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.78483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  93.6  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.08547e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.58 
 
 
223 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.00172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  6.94207e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.56676e-07  decreased coverage  3.56458e-06 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  44.12 
 
 
103 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
104 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  44.55 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
104 aa  92  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.02 
 
 
198 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  46.08 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.4347e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  8.42566e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.39742e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
102 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.81834e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
115 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  1.96723e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
170 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.510472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>