More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3876 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 396 aa  754    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  89.61 
 
 		 393 aa  604  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  70.65 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  57.95 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  62.47 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  62.16 
 
 		 404 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  59.38 
 
 		 409 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  62.88 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  59.74 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  62.13 
 
 		 415 aa  352  8.999999999999999e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  61.1 
 
 		 401 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  59.13 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  59.67 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  56.68 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  49.48 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  48.59 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  48.34 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  48.34 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  49.59 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  50.86 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  47.83 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  46.2 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  35.43 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  37.24 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  36.75 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  36.45 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.43 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  32.66 
 
 		 407 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.92 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.66 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.66 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.66 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.41 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  32.18 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.18 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.41 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.66 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  32.41 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  32.41 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.18 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.41 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.18 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  31.93 
 
 		 407 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.91 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.91 
 
 		 393 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  35.52 
 
 		 414 aa  155  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  32.09 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  31.2 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  31.03 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  30.97 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  31.1 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  30.25 
 
 		 666 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  29.53 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  30.64 
 
 		 585 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 657 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 		 587 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.82 
 
 		 587 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  30.09 
 
 		 782 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.36 
 
 		 586 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.2 
 
 		 587 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 586 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 586 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.77 
 
 		 585 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  31.12 
 
 		 741 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  29.12 
 
 		 585 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.82 
 
 		 585 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 		 757 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  28.07 
 
 		 741 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 585 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 		 586 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4482  sodium/hydrogen exchanger  31.67 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  25.9 
 
 		 664 aa  97.4  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  27.76 
 
 		 652 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 		 671 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 747 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.89 
 
 		 745 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  26.84 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  26.84 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  26.84 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.18 
 
 		 671 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 672 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  26.84 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 		 777 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  29.08 
 
 		 656 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 567 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  30.71 
 
 		 567 aa  94  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  26.58 
 
 		 375 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  26.32 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.43 
 
 		 567 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  31.37 
 
 		 670 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 		 673 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.79 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.79 
 
 		 720 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  26.71 
 
 		 586 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  25.19 
 
 		 650 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>