More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0907 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25100  thioredoxin reductase  61.96 
 
 		 552 aa  685    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 547 aa  1124    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  48.11 
 
 		 638 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  42.42 
 
 		 555 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1451  Alkyl hydroperoxide reductase, large subunit  39.96 
 
 		 569 aa  432  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.61 
 
 		 556 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.78 
 
 		 555 aa  421  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000005332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  41.08 
 
 		 409 aa  253  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  41.23 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  42.47 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.09 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.86 
 
 		 319 aa  250  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.56 
 
 		 316 aa  246  6.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.40354  normal  0.494294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  40.78 
 
 		 304 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  38.22 
 
 		 323 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  44 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 310 aa  238  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  41.16 
 
 		 306 aa  238  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  38.49 
 
 		 311 aa  238  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.18 
 
 		 407 aa  237  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 304 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.21 
 
 		 403 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000828046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.51 
 
 		 306 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.26 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  41.69 
 
 		 302 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  39.56 
 
 		 340 aa  230  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  39.23 
 
 		 308 aa  229  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40.32 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40.32 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  39.67 
 
 		 306 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40.32 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.06 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  40.71 
 
 		 336 aa  227  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  40.07 
 
 		 304 aa  224  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 308 aa  224  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2670  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 410 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.373166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  41.46 
 
 		 317 aa  223  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 312 aa  222  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  40.73 
 
 		 320 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 332 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  37.54 
 
 		 318 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  37.34 
 
 		 310 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  38.8 
 
 		 318 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  41.88 
 
 		 312 aa  218  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  40.58 
 
 		 311 aa  217  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 315 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  38.11 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  39.48 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  43.09 
 
 		 326 aa  216  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  37.22 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  37.22 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  37.22 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  40.58 
 
 		 311 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  38.24 
 
 		 311 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  38.51 
 
 		 309 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  37.85 
 
 		 318 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  37.22 
 
 		 318 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  37.22 
 
 		 318 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  40.45 
 
 		 311 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  37.22 
 
 		 318 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  37.22 
 
 		 318 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  39.87 
 
 		 311 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  37.22 
 
 		 309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  37.79 
 
 		 306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  40.65 
 
 		 311 aa  213  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  38.66 
 
 		 310 aa  213  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  38.46 
 
 		 318 aa  213  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.54 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  37.54 
 
 		 318 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  36.98 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  36.76 
 
 		 311 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  40.98 
 
 		 319 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  38.46 
 
 		 316 aa  211  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  38.11 
 
 		 334 aa  211  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  36.76 
 
 		 311 aa  211  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  37.13 
 
 		 317 aa  211  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  37.66 
 
 		 310 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  40.45 
 
 		 311 aa  210  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25220  thioredoxin-disulfide reductase  41.48 
 
 		 313 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000419952  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0851  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.16 
 
 		 406 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000113815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  39.23 
 
 		 316 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  36.98 
 
 		 361 aa  208  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  39.62 
 
 		 310 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  41.1 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  39.57 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  40.66 
 
 		 318 aa  207  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  38.36 
 
 		 308 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  39.62 
 
 		 309 aa  206  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  37.3 
 
 		 308 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  40.62 
 
 		 304 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  38.76 
 
 		 335 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  40.89 
 
 		 306 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  37.25 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  40 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  37.38 
 
 		 319 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  35.8 
 
 		 346 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  39.1 
 
 		 316 aa  204  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  39.12 
 
 		 311 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18300  thioredoxin reductase  38.24 
 
 		 303 aa  204  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  40.5 
 
 		 321 aa  204  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>