More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0707 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  100 
 
 		 274 aa  561  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  70.26 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  65.4 
 
 		 240 aa  324  9e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  63.36 
 
 		 239 aa  314  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  64.07 
 
 		 237 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  63.36 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  64.07 
 
 		 237 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  62.5 
 
 		 242 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  60.5 
 
 		 240 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  62.5 
 
 		 240 aa  312  4.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  61.51 
 
 		 239 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  60.08 
 
 		 240 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  59.83 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  59.83 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  61.83 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  61.83 
 
 		 251 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  62.5 
 
 		 237 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  61.83 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  62.77 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  61.9 
 
 		 240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  61.8 
 
 		 246 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  62.82 
 
 		 239 aa  305  7e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  61.04 
 
 		 234 aa  304  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  61.47 
 
 		 240 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  60.61 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  61.47 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  60.25 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  60.61 
 
 		 234 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  58.9 
 
 		 240 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  60.25 
 
 		 239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  63.2 
 
 		 236 aa  301  6.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1274  uridylate kinase  60.94 
 
 		 239 aa  301  6.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.315976  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  60.34 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  61.9 
 
 		 242 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  60.61 
 
 		 234 aa  301  9e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  61.04 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  61.04 
 
 		 237 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  61.28 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  61.18 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0574  uridylate kinase  61.21 
 
 		 235 aa  300  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  59.74 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2388  uridylate kinase  59.39 
 
 		 244 aa  299  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0822342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  59.31 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  59.91 
 
 		 235 aa  299  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  61.54 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  58.33 
 
 		 242 aa  298  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  60.61 
 
 		 245 aa  298  6e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  57.92 
 
 		 243 aa  298  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  57.92 
 
 		 243 aa  298  8e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  59.48 
 
 		 236 aa  298  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  58.58 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  59.48 
 
 		 237 aa  297  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  60.17 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  59.4 
 
 		 242 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  58.87 
 
 		 242 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  58.97 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  59.15 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  58.19 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  59.05 
 
 		 235 aa  295  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  56.47 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  60.43 
 
 		 249 aa  294  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  57.08 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  59.15 
 
 		 239 aa  294  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  59.05 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0476  uridylate kinase  58.65 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0113998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  60.5 
 
 		 237 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  58.44 
 
 		 245 aa  292  5e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0884  hypothetical protein  61.44 
 
 		 238 aa  291  6e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  58.37 
 
 		 238 aa  291  7e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  58.62 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  57.63 
 
 		 239 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1163  uridylate kinase  59.48 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.221517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1518  uridylate kinase  59.75 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.63 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  57.45 
 
 		 239 aa  289  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  58.16 
 
 		 243 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  59.49 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  58.62 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  58.65 
 
 		 240 aa  288  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3408  uridylate kinase  56.38 
 
 		 279 aa  288  6e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0485222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  60.78 
 
 		 239 aa  288  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0240  uridylate kinase  55.42 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.428949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2111  uridylate kinase  60.17 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  58.05 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  58.23 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  58.87 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  57.33 
 
 		 235 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3211  uridylate kinase  57.2 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567635  hitchhiker  0.000000005396 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  58.44 
 
 		 236 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  56.58 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0259  uridylate kinase  61.18 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  55.23 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  55.65 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0357  uridylate kinase  57.08 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000696915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_319  uridylate kinase  57.08 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.125556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  56.54 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  54.32 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1449  uridylate kinase  58.87 
 
 		 236 aa  282  5.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  57.26 
 
 		 237 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  58.44 
 
 		 236 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>