More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0322 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  100 
 
 
305 aa  627  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  49.51 
 
 
306 aa  311  6e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  34.33 
 
 
303 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.89 
 
 
303 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 
303 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 
303 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 
303 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54533e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 
303 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.45 
 
 
303 aa  166  6e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.79 
 
 
303 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.70139e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.12 
 
 
303 aa  162  5e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.12 
 
 
303 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.87 
 
 
303 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  31.05 
 
 
305 aa  153  3e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  34.42 
 
 
308 aa  152  8e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.34171e-05 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  31.35 
 
 
303 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.66616e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.94 
 
 
304 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  31.12 
 
 
300 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.28039e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  29.7 
 
 
304 aa  145  7e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  30.94 
 
 
306 aa  145  8e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 
306 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  32.53 
 
 
308 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.63995e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 
306 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  31.83 
 
 
306 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 
303 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30.19 
 
 
306 aa  142  1e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  30.72 
 
 
302 aa  141  1e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  26.8 
 
 
308 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  32.46 
 
 
307 aa  139  8e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  28.76 
 
 
302 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  30.82 
 
 
303 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  27.36 
 
 
305 aa  135  1e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  32.53 
 
 
303 aa  129  7e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  28.99 
 
 
306 aa  126  4e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  27.18 
 
 
338 aa  125  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  27.65 
 
 
311 aa  123  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  32.06 
 
 
314 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  30.56 
 
 
303 aa  120  4e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 
315 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10184e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  30.84 
 
 
313 aa  118  1e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  29.31 
 
 
324 aa  117  2e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 
310 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  31.53 
 
 
315 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1103  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 
303 aa  117  4e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 
309 aa  116  4e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  33.97 
 
 
315 aa  115  9e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  32.03 
 
 
308 aa  114  2e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.23 
 
 
315 aa  114  2e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.82 
 
 
307 aa  114  2e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.84 
 
 
311 aa  113  4e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.98 
 
 
315 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  30.95 
 
 
310 aa  112  1e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
308 aa  111  2e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  6.7569e-09 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  30.21 
 
 
312 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  29.45 
 
 
311 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 
310 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  32.09 
 
 
302 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  28.89 
 
 
310 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.36585e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.07 
 
 
307 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  31.4 
 
 
314 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  27.83 
 
 
313 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 
313 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  29.13 
 
 
315 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.43 
 
 
311 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  29.76 
 
 
306 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  25.24 
 
 
313 aa  103  5e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  29.39 
 
 
310 aa  103  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  28.96 
 
 
311 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  30.34 
 
 
325 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  28.28 
 
 
310 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 
332 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  29.29 
 
 
316 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  30.16 
 
 
310 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  30.16 
 
 
310 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 
325 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  28.08 
 
 
311 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  27.86 
 
 
311 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  28.62 
 
 
310 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  27.71 
 
 
318 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  28.62 
 
 
310 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  27.93 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  28.46 
 
 
316 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D04  tagatose-6-phosphate kinase  30.5 
 
 
286 aa  99.4  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0175284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  31.27 
 
 
327 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  28.24 
 
 
312 aa  99  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 
318 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 
336 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  27.86 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2661  1-phosphofructokinase  30.34 
 
 
302 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156001  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  27.52 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  28.66 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 
311 aa  95.5  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  27.4 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  30.65 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  28.63 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  4.83919e-07 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  29.26 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  27.61 
 
 
318 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  30.12 
 
 
319 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  27.91 
 
 
312 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  28.53 
 
 
314 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>