53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4314 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  100 
 
 
186 aa  361  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4300  OstA family protein  57.86 
 
 
181 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4322  OstA family protein  57.86 
 
 
181 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4169  hypothetical protein  56.83 
 
 
180 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.67 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  25 
 
 
239 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  25.99 
 
 
223 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1769  hypothetical protein  29.21 
 
 
179 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  29.06 
 
 
169 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  28.78 
 
 
212 aa  54.3  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.61 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  26.77 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1507  OstA family protein  27.81 
 
 
196 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  decreased coverage  0.000611674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  24.31 
 
 
250 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  24.19 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  39.71 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.82 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  27.12 
 
 
225 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  32.53 
 
 
285 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  24.53 
 
 
199 aa  47.8  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  28.45 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  28.45 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  25.68 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  22.98 
 
 
242 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.42 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  23.64 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  30.86 
 
 
764 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  26.47 
 
 
221 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.5 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.5 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.5 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  29.5 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.5 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.5 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  27.66 
 
 
765 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  27.37 
 
 
773 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  23.91 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.67 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  29.46 
 
 
170 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 
765 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 
765 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 
765 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 
765 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  26.32 
 
 
765 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.42 
 
 
162 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 
765 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  26.6 
 
 
765 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  26.36 
 
 
774 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  27.66 
 
 
773 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  24.75 
 
 
765 aa  41.2  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.87 
 
 
162 aa  41.2  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  30.17 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  30.51 
 
 
200 aa  40.8  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>