More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1026 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
167 aa  344  4e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  64.33 
 
 
164 aa  205  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  62.03 
 
 
163 aa  205  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  62.66 
 
 
164 aa  204  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  68.9 
 
 
197 aa  201  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  63.87 
 
 
164 aa  201  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  59.87 
 
 
310 aa  181  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  55.76 
 
 
310 aa  179  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  60.49 
 
 
197 aa  175  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  59.31 
 
 
310 aa  174  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  66.43 
 
 
322 aa  172  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.69 
 
 
202 aa  164  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  56.43 
 
 
161 aa  164  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  57.04 
 
 
376 aa  163  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  54.43 
 
 
372 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  53.85 
 
 
376 aa  158  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  51.63 
 
 
175 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  53.9 
 
 
657 aa  157  6e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  58.33 
 
 
206 aa  156  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  49.7 
 
 
175 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.99 
 
 
167 aa  153  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.61 
 
 
357 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  52.48 
 
 
174 aa  151  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  52.05 
 
 
254 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.8 
 
 
378 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  53.15 
 
 
176 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3720  peptidylprolyl isomerase  63.5 
 
 
163 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.392854  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  57.36 
 
 
629 aa  148  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  54.48 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  52.31 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  51.37 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1485  peptidylprolyl isomerase  52.48 
 
 
141 aa  145  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  53.85 
 
 
287 aa  144  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3544  peptidylprolyl isomerase  61.31 
 
 
163 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0928419  normal  0.154699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
172 aa  144  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.67 
 
 
201 aa  143  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  49.33 
 
 
172 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  52.82 
 
 
181 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  49.67 
 
 
177 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4201  peptidylprolyl isomerase  60.14 
 
 
171 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.231436  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  49.67 
 
 
178 aa  142  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  52.82 
 
 
187 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  53.49 
 
 
178 aa  141  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1396  peptidylprolyl isomerase  52.52 
 
 
141 aa  141  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  48.72 
 
 
178 aa  141  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  63.78 
 
 
194 aa  141  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  52.21 
 
 
571 aa  140  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-binding  51.82 
 
 
143 aa  140  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00742073  normal  0.1669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  46.02 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1082  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.8 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  50.36 
 
 
219 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  55.3 
 
 
665 aa  138  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  49.32 
 
 
181 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1427  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B)(rotamase B)  50 
 
 
162 aa  138  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  48.1 
 
 
188 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  46.29 
 
 
179 aa  137  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1305  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  51.06 
 
 
160 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  51.75 
 
 
241 aa  137  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  50.69 
 
 
188 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0558  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  51.06 
 
 
160 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.608386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  51.54 
 
 
254 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1769  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.24 
 
 
141 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.995524  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  49.65 
 
 
176 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1186  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B  51.06 
 
 
160 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2344  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.55 
 
 
139 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  45.45 
 
 
533 aa  135  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  52.63 
 
 
629 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  52.31 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  54.42 
 
 
182 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1460  peptidylprolyl isomerase  52.52 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  51.18 
 
 
181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  51.49 
 
 
156 aa  131  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  52 
 
 
168 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  48.25 
 
 
266 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  52 
 
 
168 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3653  Peptidylprolyl isomerase  43.71 
 
 
247 aa  130  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000157501  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  52 
 
 
168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  50.76 
 
 
573 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1982  Peptidylprolyl isomerase  50.76 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  47.76 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.58 
 
 
195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  53.74 
 
 
182 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  49.63 
 
 
222 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  45.04 
 
 
160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5201  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  54.74 
 
 
145 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12899  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  54.93 
 
 
175 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  54.93 
 
 
175 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  54.93 
 
 
175 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  54 
 
 
182 aa  124  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0891  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.57 
 
 
164 aa  124  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  48.54 
 
 
178 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1513  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B (PPIase B; rotamase B)  50 
 
 
164 aa  123  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00601404  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1053  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
208 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1036  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase) (rotamase)  52.48 
 
 
163 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000295334  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  55.78 
 
 
173 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1025  peptidylprolyl isomerase  50 
 
 
209 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000366369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.41 
 
 
195 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  49.68 
 
 
179 aa  122  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34076  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  53.73 
 
 
164 aa  120  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>