52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0597 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  352  1e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  51.79 
 
 
170 aa  169  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  44.52 
 
 
168 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  42.42 
 
 
170 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  39.13 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  44 
 
 
174 aa  128  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  41.72 
 
 
177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  33.72 
 
 
177 aa  123  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  36.05 
 
 
189 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  41.33 
 
 
169 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  31.58 
 
 
182 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  33.57 
 
 
168 aa  94  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.67 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  31.47 
 
 
160 aa  82  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  33.12 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  34.78 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  33.11 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  26.45 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  28.87 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  29.25 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.86 
 
 
194 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  38.14 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  32.08 
 
 
189 aa  61.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
209 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  25.79 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.19 
 
 
192 aa  57.4  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.62 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  31.19 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  34.62 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  28.86 
 
 
191 aa  55.1  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.19 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.96 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  35.05 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  35.11 
 
 
189 aa  52  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  29.25 
 
 
189 aa  51.2  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  28 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.36 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.48 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.37 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.69 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.67 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  26.74 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  26.74 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  31.96 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.74 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  28.18 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  24.66 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  23.45 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.39 
 
 
176 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  28.07 
 
 
216 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.88 
 
 
192 aa  40.8  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>