More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5883 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 509 aa  989    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  66.34 
 
 		 575 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  65.06 
 
 		 521 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  65.61 
 
 		 509 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  65.95 
 
 		 501 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  66.2 
 
 		 495 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  66.2 
 
 		 495 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  66.2 
 
 		 495 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  63.1 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  64.21 
 
 		 511 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  59.34 
 
 		 517 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  64.97 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  61.03 
 
 		 520 aa  541  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  63.37 
 
 		 509 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  56.81 
 
 		 529 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  57.74 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  57.48 
 
 		 495 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  56.94 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  57 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  55.23 
 
 		 491 aa  475  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  59.07 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  55 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  54.07 
 
 		 490 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  54.67 
 
 		 527 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  54.44 
 
 		 476 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  54.67 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  47.91 
 
 		 500 aa  418  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  46.68 
 
 		 506 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  46.08 
 
 		 506 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  46.29 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  46.29 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  46.29 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  50.81 
 
 		 487 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  49.09 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  51.62 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  49.29 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  48.38 
 
 		 484 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  49.2 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  47.46 
 
 		 483 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  51.11 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  46 
 
 		 475 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  48.68 
 
 		 484 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  46.96 
 
 		 787 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  49.6 
 
 		 483 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  48.62 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  49.2 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  47.81 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.38 
 
 		 772 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  50.5 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  46.54 
 
 		 484 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  45.36 
 
 		 776 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  50.4 
 
 		 520 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  49.5 
 
 		 501 aa  389  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  49.49 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  49.09 
 
 		 490 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  42.66 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  44.23 
 
 		 560 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  47.57 
 
 		 486 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.86 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  45.93 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  48.48 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  49.6 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  45.21 
 
 		 485 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  46.61 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  49.9 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  40.12 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  46.06 
 
 		 534 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  50 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  50 
 
 		 531 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  47.98 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  50 
 
 		 523 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.64 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  50 
 
 		 585 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  50.2 
 
 		 511 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  50 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  49.6 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  50 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  50.2 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  44 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  48.32 
 
 		 505 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  48.99 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  44.51 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  45.2 
 
 		 863 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  43.37 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  44.59 
 
 		 536 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  46.79 
 
 		 797 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  40.23 
 
 		 513 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  48.99 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  41.62 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  49.1 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  44.72 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  44.06 
 
 		 526 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  44.56 
 
 		 863 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  44.38 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 541 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  42.52 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  48.6 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  46.82 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.74 
 
 		 777 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>