More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5687 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  76.69 
 
 		 472 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  100 
 
 		 474 aa  952    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  71.61 
 
 		 472 aa  694    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  69.85 
 
 		 471 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  75.94 
 
 		 477 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  77.43 
 
 		 476 aa  741    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  76.48 
 
 		 472 aa  737    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  67.59 
 
 		 482 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  84.75 
 
 		 474 aa  814    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  71.82 
 
 		 472 aa  698    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  76.48 
 
 		 472 aa  737    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  76.69 
 
 		 472 aa  743    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  68.44 
 
 		 482 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  76.48 
 
 		 472 aa  737    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  75.85 
 
 		 472 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  66.53 
 
 		 476 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  63.54 
 
 		 505 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  62.79 
 
 		 478 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  61.89 
 
 		 487 aa  570  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  62.85 
 
 		 476 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  60.93 
 
 		 476 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  61.44 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  61.91 
 
 		 476 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  62.63 
 
 		 481 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  60.51 
 
 		 477 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  63.19 
 
 		 474 aa  544  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  62.85 
 
 		 472 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  59.28 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  59.57 
 
 		 471 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  57.92 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  59.66 
 
 		 489 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  59.49 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  56.99 
 
 		 478 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  60 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  57.96 
 
 		 472 aa  521  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  57.02 
 
 		 495 aa  499  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  55.65 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  48.65 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  45.89 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  43.52 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  47.02 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  47.5 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  47.07 
 
 		 482 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.97 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  46.5 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  46.82 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  48.41 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  45.32 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  44.42 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.22 
 
 		 584 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  45.07 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  43.95 
 
 		 583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  46.27 
 
 		 589 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  46.17 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  48.41 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  46.57 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  45.96 
 
 		 596 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  42.32 
 
 		 583 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  45.74 
 
 		 596 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  46.48 
 
 		 590 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  45.3 
 
 		 480 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  47.47 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  42.8 
 
 		 583 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  45.61 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  44.33 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  46.19 
 
 		 582 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  42.04 
 
 		 580 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  48.11 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  48.11 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  45.76 
 
 		 600 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  46.09 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  45.05 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  46.09 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  48.32 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  45.05 
 
 		 586 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  45.61 
 
 		 605 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  44.63 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  46.17 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  43.76 
 
 		 580 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  43.9 
 
 		 580 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  42.26 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  44.92 
 
 		 601 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  44.28 
 
 		 587 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  46.41 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  42.07 
 
 		 590 aa  384  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  43.8 
 
 		 476 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  40.93 
 
 		 476 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  43.7 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  41.93 
 
 		 585 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  44.44 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  41.93 
 
 		 585 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  44.49 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  44.12 
 
 		 585 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  40.88 
 
 		 585 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 585 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 585 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  44.56 
 
 		 592 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  43.93 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>