125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4714 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4714  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
439 aa  887    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6521  alpha/beta hydrolase fold protein  54.88 
 
 
432 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.17034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06790  prolyl aminopeptidase 2  54.33 
 
 
441 aa  428  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  51.82 
 
 
423 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4559  prolyl aminopeptidase 2  50.24 
 
 
421 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2460  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 
453 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0669  putative hydrolse  49.53 
 
 
447 aa  375  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.272037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2021  putative proline iminopeptidase  48.58 
 
 
419 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0646  hydrolase, alpha/beta domain protein  45.45 
 
 
460 aa  355  1e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.291247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0134  alpha/beta hydrolase fold protein  50.97 
 
 
420 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3689  putative prolyl aminopeptidase  42.65 
 
 
430 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1634  alpha/beta hydrolase fold  38.9 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2270  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
429 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.201892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1661  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
429 aa  299  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.485679  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001130  putative prolyl aminopeptidase  40.2 
 
 
431 aa  298  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.047339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3055  proline iminopeptidase  37.77 
 
 
424 aa  296  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0398  alpha/beta hydrolase fold protein  43.74 
 
 
428 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167053  normal  0.0238108 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2227  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
429 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2752  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
429 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2955  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 
431 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2828  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2735  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 
429 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3642  alpha/beta hydrolase fold protein  42.76 
 
 
412 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1624  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 
429 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.610603  normal  0.321544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2429  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
429 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1492  prolyl aminopeptidase 2  36.58 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1434  prolyl aminopeptidase 2  36.58 
 
 
429 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1499  prolyl aminopeptidase 2  36.58 
 
 
429 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2143  alpha/beta hydrolase fold  38.95 
 
 
439 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22944  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1410  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2072  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
463 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  42.08 
 
 
439 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3903  alpha/beta hydrolase fold  42.34 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0642789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11240  hypothetical protein with alpha/beta hydrolase fold  41.75 
 
 
488 aa  257  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.163814  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00350  prolyl aminopeptidase 2  39.29 
 
 
443 aa  229  9e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.358137 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02092  Putative prolyl aminopeptidase Fragment (EC 3.4.11.5) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT1]  34.38 
 
 
443 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.707401  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05870  prolyl aminopeptidase 2  39.52 
 
 
424 aa  225  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.208476  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33188  predicted protein  33.76 
 
 
510 aa  216  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  31.63 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47448  predicted protein  32.57 
 
 
692 aa  187  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.445648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  30.52 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3544  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
316 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.369893  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  29.61 
 
 
329 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  22.34 
 
 
291 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  28.26 
 
 
329 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  30.81 
 
 
675 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  30.92 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3085  proline iminopeptidase  30.26 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  28.73 
 
 
476 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  29.71 
 
 
320 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  30.88 
 
 
330 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  25.99 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
315 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
287 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
308 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
291 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3058  Prolyl aminopeptidase  31.33 
 
 
329 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  26.81 
 
 
301 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4151  proline iminopeptidase  27.33 
 
 
329 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  28.89 
 
 
298 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  25.17 
 
 
669 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  23.78 
 
 
480 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  26.81 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  25.35 
 
 
670 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  25 
 
 
306 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  23.98 
 
 
301 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  26.81 
 
 
301 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2191  prolyl aminopeptidase  27.78 
 
 
321 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73475  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  30.68 
 
 
323 aa  48.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4358  proline iminopeptidase  31.45 
 
 
361 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0513684  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  26.81 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  26.81 
 
 
301 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  35.16 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  32.77 
 
 
313 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  26.87 
 
 
291 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  35.29 
 
 
311 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  28.97 
 
 
318 aa  47.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3908  prolyl aminopeptidase  28.32 
 
 
310 aa  47.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  26.81 
 
 
301 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  27.63 
 
 
303 aa  46.6  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1698  prolyl aminopeptidase  33.61 
 
 
320 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  31.93 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  33.05 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  30 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  29.92 
 
 
323 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  29.41 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  30.87 
 
 
337 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  24.82 
 
 
313 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  34.78 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  31.93 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  33.9 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  30.83 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2056  proline iminopeptidase  30.77 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  33.9 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  27.55 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  27.48 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  29.68 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  24.14 
 
 
517 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>