244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3544 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3544  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
316 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.369893  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0303  alpha/beta hydrolase fold  52.79 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.136921  hitchhiker  0.000000724051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4617  prolyl aminopeptidase  50.66 
 
 
315 aa  317  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.920468  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3908  prolyl aminopeptidase  47.42 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  47.33 
 
 
318 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0317  prolyl aminopeptidase  47.54 
 
 
318 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.463031  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0312  prolyl aminopeptidase  47.99 
 
 
301 aa  263  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.361295  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3707  prolyl aminopeptidase  47.3 
 
 
301 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3403  proline iminopeptidase, putative  47.74 
 
 
295 aa  255  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0320  alpha/beta hydrolase fold  42.77 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0316  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 
317 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  42.44 
 
 
321 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0315  alpha/beta hydrolase fold  42.12 
 
 
317 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0142975  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  33.85 
 
 
320 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  32.35 
 
 
318 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  32.69 
 
 
323 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  32.8 
 
 
335 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  32.57 
 
 
313 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  33.6 
 
 
323 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  35.8 
 
 
320 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  36.78 
 
 
328 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  35.17 
 
 
328 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  30.87 
 
 
323 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  36.26 
 
 
326 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  34.08 
 
 
319 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  31.29 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  35.18 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  35.77 
 
 
316 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  32.5 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  31.29 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  31.29 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  35.11 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  31.29 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  29.68 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  32.56 
 
 
316 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  29.77 
 
 
316 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  32.81 
 
 
317 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  28.2 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  30.56 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  37.79 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4410  proline iminopeptidase  33.46 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34926 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  32.56 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  31.75 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  37.79 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  37.4 
 
 
322 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  31.23 
 
 
328 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1698  prolyl aminopeptidase  33.59 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  33.99 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  34.52 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  30.38 
 
 
322 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  31.66 
 
 
318 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  33.59 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  29.57 
 
 
323 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07350  prolyl aminopeptidase  30.94 
 
 
332 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  29.9 
 
 
320 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  33.07 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  32.2 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  30.84 
 
 
325 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  33.59 
 
 
318 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  29.84 
 
 
323 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  33.98 
 
 
313 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  33.46 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  33.46 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  31.33 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  31.33 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  31.33 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  33.46 
 
 
310 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  32.83 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  33.46 
 
 
310 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  34.63 
 
 
313 aa  133  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  32.18 
 
 
316 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  34.63 
 
 
313 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  32.18 
 
 
316 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  34.35 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1031  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  34.69 
 
 
298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  31.89 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  31.25 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  32.05 
 
 
313 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  34.23 
 
 
333 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  29.93 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  32.7 
 
 
310 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  32.68 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  29.88 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0330  proline iminopeptidase  32.95 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.268433  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0314  proline iminopeptidase  32.95 
 
 
316 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  30.74 
 
 
329 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  30.23 
 
 
414 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  29.8 
 
 
436 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  30.19 
 
 
329 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  29.8 
 
 
429 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  29.8 
 
 
429 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  29.8 
 
 
429 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  29.9 
 
 
312 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  29.46 
 
 
322 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3668  proline iminopeptidase  30.55 
 
 
330 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  29.9 
 
 
312 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1856  proline iminopeptidase  31.29 
 
 
322 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.0201858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  29.9 
 
 
312 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>