More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2967 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 384 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  62.18 
 
 		 421 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  59.8 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  57.21 
 
 		 407 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  48.31 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  51.2 
 
 		 381 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  44.82 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  42.2 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  48.41 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  47.46 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 		 391 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  43.42 
 
 		 386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  40.99 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  35.2 
 
 		 514 aa  216  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  41.49 
 
 		 393 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  36.69 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  39.53 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  35.64 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  35.52 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  36.22 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  34.04 
 
 		 390 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  40.1 
 
 		 370 aa  190  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  35.16 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  32.38 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  37.14 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  34.75 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  35.26 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  34.51 
 
 		 391 aa  179  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  34.79 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  32.51 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  32.6 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  30.91 
 
 		 397 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  29.84 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  31.88 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  27.66 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  33.93 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  27.08 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  26.6 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  31.61 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  30.81 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  26.6 
 
 		 383 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  32.61 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  26.6 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  31.34 
 
 		 393 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  30.41 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  26.6 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  30.46 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2960  aminotransferase, classes I and II  28.37 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  29.38 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  26.6 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  26.13 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  26.13 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  35.09 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  36.04 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  32.79 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  35.96 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  35.11 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  26.13 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  32.97 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  32.97 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  35.29 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  29.89 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  30.52 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  26.06 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  34.27 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  31.32 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  30.14 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  32.29 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  27.41 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6328  aminotransferase class I and II  36.74 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.657142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  31.15 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  26.36 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  32.61 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  30.91 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  34.45 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  30.95 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  35.12 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  29.9 
 
 		 387 aa  155  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  31.79 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  30.97 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  31.78 
 
 		 390 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  34.04 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  27.06 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  28.61 
 
 		 386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  31.91 
 
 		 398 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  32.4 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  29.56 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  36.02 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  29.06 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  32.14 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  28.53 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>