246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1772 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  100 
 
 		 580 aa  1132    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6583  aminotransferase, class V  39.23 
 
 		 425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  39.13 
 
 		 216 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  38.46 
 
 		 224 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  37.62 
 
 		 224 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  37.02 
 
 		 221 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  37.44 
 
 		 224 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  35.82 
 
 		 263 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  39.71 
 
 		 230 aa  123  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  32.26 
 
 		 221 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  33.77 
 
 		 274 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  30 
 
 		 215 aa  109  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  33.77 
 
 		 234 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  30.71 
 
 		 376 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  31.65 
 
 		 223 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  34.07 
 
 		 224 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  30.77 
 
 		 238 aa  103  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  30.95 
 
 		 226 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  31.43 
 
 		 226 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  30.92 
 
 		 240 aa  103  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  31.1 
 
 		 226 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  31.1 
 
 		 226 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  37.62 
 
 		 220 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  31.9 
 
 		 219 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  31.9 
 
 		 219 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  31.9 
 
 		 219 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  31.9 
 
 		 219 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  32.24 
 
 		 227 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  29.32 
 
 		 378 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  30.37 
 
 		 223 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  33.17 
 
 		 215 aa  97.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  30 
 
 		 237 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  28.45 
 
 		 381 aa  96.3  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  34.63 
 
 		 211 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  30.73 
 
 		 240 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  30.62 
 
 		 210 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  30.73 
 
 		 240 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  30.62 
 
 		 210 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  30.29 
 
 		 221 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  30.73 
 
 		 240 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  27.45 
 
 		 217 aa  92  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  30.61 
 
 		 372 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  28.78 
 
 		 248 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  27.18 
 
 		 222 aa  91.3  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  29.47 
 
 		 240 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  29.76 
 
 		 248 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  29.47 
 
 		 240 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  29.47 
 
 		 240 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  29.47 
 
 		 240 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  29.47 
 
 		 240 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  23.4 
 
 		 376 aa  89.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  28.64 
 
 		 249 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  29.13 
 
 		 240 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  30.24 
 
 		 240 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  29.47 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  34.69 
 
 		 214 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  27.62 
 
 		 218 aa  88.6  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  26.46 
 
 		 379 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  24.59 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  29.85 
 
 		 221 aa  87.4  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.5 
 
 		 377 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  29.44 
 
 		 206 aa  87.4  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 379 aa  87  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  30.92 
 
 		 216 aa  87  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  0.000000000000540056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3127  YheO domain protein  31.98 
 
 		 218 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  30.29 
 
 		 225 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  26.92 
 
 		 223 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0153  YheO domain-containing protein  32.66 
 
 		 210 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  28.12 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  25.51 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  31.05 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  26.76 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  29.41 
 
 		 210 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  28.71 
 
 		 222 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3404  YheO domain-containing protein  31.02 
 
 		 224 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  25.12 
 
 		 226 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  29.13 
 
 		 211 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  29.25 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  28.07 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  32.65 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  32.65 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  26.4 
 
 		 226 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  30.35 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  30.35 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  30.35 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5663  YheO domain protein  28.37 
 
 		 214 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  27 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  29.13 
 
 		 218 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  30.65 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  29.95 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>