122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4888 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  80.73 
 
 		 219 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  80.73 
 
 		 219 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  80.73 
 
 		 219 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  80.73 
 
 		 219 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  80.54 
 
 		 226 aa  377  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  80.54 
 
 		 226 aa  377  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  79.64 
 
 		 226 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  79.19 
 
 		 226 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  76.02 
 
 		 227 aa  362  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  58.69 
 
 		 215 aa  274  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  59.17 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  59.72 
 
 		 218 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  46.95 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  42.52 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  40.64 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  42.52 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  41.01 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  40.83 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  39.73 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  38.81 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  38.81 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  39.55 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  39.55 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  39.55 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  39.55 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  39.55 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  38.07 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  40.47 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.45 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  39.45 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  39.45 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  39.45 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  39.45 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  39.45 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  39.45 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  39.45 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  39.09 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  39.91 
 
 		 240 aa  167  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  37.61 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  37.61 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  37.61 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  39.15 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  33.8 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  36.2 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  35.16 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  33.95 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  33.79 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  35.45 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  34.6 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  38.01 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  31.92 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0400  YheO domain protein  29.38 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  33.96 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  33.96 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  30.05 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  32.86 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  30.58 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  29.65 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  29.95 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  30.29 
 
 		 580 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  28.85 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  31.6 
 
 		 211 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  29.95 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  31.63 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  30.92 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  29.86 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  28.85 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107006  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  28.85 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  28.85 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0276  helix-turn-helix containing protein  27.83 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  28.22 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  29.27 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  25.37 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  29.33 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  28.08 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  27.27 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  24.51 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  26.82 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  26.27 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  25 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0272  hypothetical protein  25.73 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  23.27 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  26.7 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0153  YheO domain-containing protein  25.46 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  23.7 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  23.7 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  23.7 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  24.51 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4342  YheO domain-containing protein  24.49 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  24.19 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2524  YheO domain-containing protein  27.14 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0563238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  21.78 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2000  YheO domain-containing protein  24.88 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35427  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3192  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  24.02 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2673  YheO domain-containing protein  27.01 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  24.26 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  25.88 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  0.000000000000540056 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  28.95 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>