121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3627 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  99.58 
 
 		 240 aa  494  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  97.92 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  97.92 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  97.92 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  97.92 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  97.92 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  96.67 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  87.92 
 
 		 249 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  86.25 
 
 		 248 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  86.67 
 
 		 248 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  87.5 
 
 		 240 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  85.83 
 
 		 240 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  86.67 
 
 		 240 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  86.67 
 
 		 240 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  86.67 
 
 		 240 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  68.75 
 
 		 238 aa  321  7e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  70.83 
 
 		 226 aa  318  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  67.41 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  66.07 
 
 		 237 aa  308  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  66.97 
 
 		 222 aa  285  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  47.62 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  42.99 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  40.38 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  42.52 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  40.37 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  44.81 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  39.38 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  39.63 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  40.36 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  40.36 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  41.47 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  39.45 
 
 		 221 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  41.4 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  41.4 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  41.4 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  41.4 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  38.03 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  42.11 
 
 		 221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  43.63 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  38.89 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  35.85 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  37.79 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  32.56 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0400  YheO domain protein  28.97 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  30.88 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  32.57 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  31.22 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  30.14 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  29.95 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  29.95 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  28.17 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  30.29 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  26.47 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  28.16 
 
 		 580 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  29.5 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  33.82 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  30.39 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0272  hypothetical protein  29.67 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  29.52 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  29.41 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107006  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  29.41 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  28.64 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  27.85 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  28.24 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  28.43 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  26.79 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  26.17 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  26.17 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  25.6 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  25.11 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0968  hypothetical protein  28.02 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3404  YheO domain-containing protein  28.35 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  23.94 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  24.07 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  27.01 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0276  helix-turn-helix containing protein  26.67 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  25.12 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  0.000000000000540056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  25.81 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  24.39 
 
 		 217 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  25.49 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  27.18 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  25.68 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  23.88 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  24.63 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  25.56 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  23.58 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  23.76 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  24.35 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2673  YheO domain-containing protein  27.23 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  22.27 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>