111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1820 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  47.53 
 
 
218 aa  191  8e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  47.53 
 
 
218 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107006  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  47.53 
 
 
218 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0276  helix-turn-helix containing protein  46.19 
 
 
222 aa  178  7e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0272  hypothetical protein  44.39 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  42.52 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  36.92 
 
 
210 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  36.92 
 
 
210 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  34.09 
 
 
223 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  32.39 
 
 
223 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  32.86 
 
 
211 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  32.11 
 
 
221 aa  92  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  29.65 
 
 
221 aa  91.7  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  29.6 
 
 
211 aa  88.2  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  28.12 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  27.59 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  27.59 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  30.63 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  28.14 
 
 
223 aa  84.7  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  29.09 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  29.65 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  27.71 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  28.7 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  28.7 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  28.7 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  28.7 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  27.71 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  27.35 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  27.71 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  27.71 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  27.71 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  25.65 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  26.2 
 
 
249 aa  79  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  26.52 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  28.02 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  26.09 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  25.88 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  25.76 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  25.76 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  25.76 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  26.79 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  23.35 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  26.18 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  24.24 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  25.55 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  25.55 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  25.55 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  25.55 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  25.55 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  28.82 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  23.77 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  25.33 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  24.44 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.378743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  21.46 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  26.47 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  23.01 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  27.1 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  27.78 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  22.94 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2000  YheO domain-containing protein  27.44 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35427  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  26 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  21.03 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  29.79 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  22.64 
 
 
225 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  22.03 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  18.81 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  24.55 
 
 
225 aa  61.6  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  27.87 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  22.02 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  28.37 
 
 
210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  23.53 
 
 
580 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0968  hypothetical protein  27.86 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  21.4 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  21.4 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  21.24 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  27.66 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  20.83 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2673  YheO domain-containing protein  25.53 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3192  hypothetical protein  25.52 
 
 
201 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5663  YheO domain protein  30.33 
 
 
214 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.8397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1071  hypothetical protein  29.51 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  21.2 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0400  YheO domain protein  26.87 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2540  YheO domain-containing protein  27.05 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0520  YheO domain protein  25.37 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3430  YheO domain-containing protein  26.32 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0722  YheO domain-containing protein  25.41 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0739  YheO domain-containing protein  25.41 
 
 
264 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.074862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2524  YheO domain-containing protein  21.68 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0563238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3127  YheO domain protein  21.92 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>