85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0520 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0520  YheO domain protein  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2227  hypothetical protein  47.78 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3430  YheO domain-containing protein  39.49 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  38.34 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0847  YheO domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262344  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3937  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0928038  hitchhiker  0.00381937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  38.34 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0722  YheO domain-containing protein  39.49 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0739  YheO domain-containing protein  39.49 
 
 		 264 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.074862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2540  YheO domain-containing protein  39.49 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0819  YheO domain-containing protein  40 
 
 		 264 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229038  normal  0.717767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0364  YheO-like  40 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0968  hypothetical protein  37.31 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3192  hypothetical protein  35.75 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  38.66 
 
 		 209 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  37.31 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2673  YheO domain-containing protein  35.23 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2073  YheO domain protein  32.64 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0868612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2524  YheO domain-containing protein  33.16 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0563238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1071  hypothetical protein  34.69 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5663  YheO domain protein  34.69 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.8397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2000  YheO domain-containing protein  32.64 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35427  normal  0.0222508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0153  YheO domain-containing protein  31.77 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3404  YheO domain-containing protein  33.68 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  33.86 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  32.98 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  28.57 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5755  YheO domain-containing protein  32.82 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00241536  hitchhiker  0.000000000000540056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  26.85 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  31.15 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  32.98 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  32.98 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  32.98 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  25.62 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  32.28 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4371  hypothetical protein  32.21 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04794  hypothetical protein  31.34 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  normal  0.0119092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  33.17 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  27.94 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3127  YheO domain protein  31.15 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284624  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4342  YheO domain-containing protein  31.75 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4112  YheO domain protein  32.65 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3999  YheO domain protein  32.65 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  26.11 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  31.91 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  28.85 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  24.4 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  27.86 
 
 		 580 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  27.78 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  27.78 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  28.04 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  27.96 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  27 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  29.52 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  25.76 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  22.43 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  25 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  25 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  25 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  25 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1209  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  24.74 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  23.53 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  25.45 
 
 		 221 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  29.13 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  22.97 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  24.27 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  24.19 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  25.77 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  23.56 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  23.9 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  23.9 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  24.53 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  24.53 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1451  hypothetical protein  27.32 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.112752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  23.41 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  23.41 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  22.77 
 
 		 263 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  23.08 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  27.23 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  25.12 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  21.92 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  27.1 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  20.93 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  21.9 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  24.88 
 
 		 248 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>