More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0109 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
182 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  71.86 
 
 
177 aa  253  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  69.06 
 
 
182 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  65.17 
 
 
179 aa  235  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  67.4 
 
 
182 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  66.08 
 
 
175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.88 
 
 
176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  65.9 
 
 
175 aa  231  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  69.77 
 
 
176 aa  230  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  65.09 
 
 
173 aa  227  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  63.48 
 
 
179 aa  226  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  68.64 
 
 
176 aa  222  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  66.85 
 
 
179 aa  220  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  61.4 
 
 
174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  64.24 
 
 
181 aa  218  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  64.24 
 
 
187 aa  217  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  64.16 
 
 
178 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  62.28 
 
 
174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  67.46 
 
 
178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  61.05 
 
 
181 aa  211  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  69.41 
 
 
170 aa  209  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  64.61 
 
 
179 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  67.07 
 
 
170 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  65.52 
 
 
177 aa  208  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  59.88 
 
 
181 aa  208  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  61.85 
 
 
176 aa  205  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  60.77 
 
 
206 aa  204  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  66.06 
 
 
175 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  66.06 
 
 
175 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  66.06 
 
 
175 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  63.37 
 
 
173 aa  201  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  65.06 
 
 
182 aa  200  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.34 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  63.95 
 
 
176 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  55.69 
 
 
188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  55.29 
 
 
176 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  63.64 
 
 
180 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  55.69 
 
 
188 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  61.33 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  53.49 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  61.05 
 
 
168 aa  180  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  60.47 
 
 
168 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  60.47 
 
 
168 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  51.48 
 
 
287 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  51.18 
 
 
172 aa  174  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  50.59 
 
 
172 aa  174  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  60.12 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  59.41 
 
 
168 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  50.89 
 
 
241 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  62.87 
 
 
228 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  57.53 
 
 
310 aa  166  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.43 
 
 
201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.65 
 
 
189 aa  162  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  48.57 
 
 
571 aa  159  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.3 
 
 
310 aa  156  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50 
 
 
378 aa  155  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  48.5 
 
 
266 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.82 
 
 
376 aa  154  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2158  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.41 
 
 
218 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.130314 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  47.34 
 
 
657 aa  151  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  48.82 
 
 
372 aa  147  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1651  peptidylprolyl isomerase  54.35 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.321717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.03 
 
 
357 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.68 
 
 
310 aa  141  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2207  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.17 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.554867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2295  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  52.17 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.211892  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  44.38 
 
 
174 aa  137  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  39.61 
 
 
629 aa  137  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  47.93 
 
 
376 aa  133  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  44.44 
 
 
665 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.75 
 
 
196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  46.43 
 
 
629 aa  132  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  46.43 
 
 
178 aa  131  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  45.81 
 
 
181 aa  131  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.72 
 
 
468 aa  130  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.25 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  38.69 
 
 
197 aa  127  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  46.29 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  41.21 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0954  peptidylprolyl isomerase  38.94 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0973  peptidylprolyl isomerase  38.94 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  39.42 
 
 
197 aa  124  6e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  45.88 
 
 
164 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  45.88 
 
 
164 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.82 
 
 
466 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2391  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.11 
 
 
322 aa  123  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  41.18 
 
 
160 aa  122  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.71 
 
 
164 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  42.94 
 
 
163 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.88 
 
 
197 aa  121  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.1 
 
 
195 aa  120  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1026  Peptidylprolyl isomerase  51.7 
 
 
167 aa  120  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  43.11 
 
 
156 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  54.07 
 
 
197 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  41.24 
 
 
573 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  43.26 
 
 
222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  42.53 
 
 
181 aa  117  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  40.35 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0729  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.65 
 
 
167 aa  115  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>