48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0042 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
249 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  46.37 
 
 
250 aa  174  2e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  44.62 
 
 
253 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  42.98 
 
 
270 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  47.8 
 
 
240 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  42.59 
 
 
247 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  49.72 
 
 
247 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  46.45 
 
 
254 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  44.07 
 
 
230 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  46.4 
 
 
233 aa  135  6e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  39.36 
 
 
251 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  44.32 
 
 
237 aa  131  1e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  41.12 
 
 
247 aa  128  1e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  44.79 
 
 
244 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  44.97 
 
 
251 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  38.22 
 
 
265 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  32.8 
 
 
243 aa  80.9  2e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  32.74 
 
 
277 aa  73.2  4e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  33.71 
 
 
184 aa  70.5  3e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  35.29 
 
 
175 aa  69.3  5e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  37.2 
 
 
342 aa  69.3  6e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  30.93 
 
 
206 aa  66.6  3e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  26.97 
 
 
206 aa  64.7  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  31.11 
 
 
206 aa  64.7  1e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  30.41 
 
 
206 aa  64.3  2e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.14878e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  31.11 
 
 
206 aa  63.9  2e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.55275e-15 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  30.41 
 
 
206 aa  64.3  2e-09  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  31.25 
 
 
206 aa  64.3  2e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  30.05 
 
 
334 aa  63.5  3e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  30.05 
 
 
351 aa  63.5  3e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  30.56 
 
 
206 aa  61.6  1e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  30.56 
 
 
206 aa  61.6  1e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  31.88 
 
 
264 aa  61.2  1e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  59.7  5e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.64517e-07 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  33.1 
 
 
178 aa  58.5  9e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  38.03 
 
 
196 aa  56.6  3e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  30.99 
 
 
328 aa  57  3e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  33.12 
 
 
176 aa  54.3  2e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  31.41 
 
 
180 aa  51.6  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  31.14 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  30.19 
 
 
176 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  27.22 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  27.07 
 
 
327 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  31.11 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  32.31 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  25.71 
 
 
321 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  31.94 
 
 
166 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  26.02 
 
 
337 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>