268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3205 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  67.48 
 
 
483 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  67.35 
 
 
487 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  67.42 
 
 
482 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  66.6 
 
 
483 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  73.26 
 
 
470 aa  700    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  67.08 
 
 
483 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  67.28 
 
 
483 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  78.53 
 
 
475 aa  791    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  77.24 
 
 
476 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  67.97 
 
 
481 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  100 
 
 
476 aa  986    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  67.08 
 
 
483 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  72.21 
 
 
472 aa  682    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  66.87 
 
 
483 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  67.28 
 
 
483 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  67.08 
 
 
483 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  77.31 
 
 
471 aa  757    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  84.03 
 
 
481 aa  838    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  79.41 
 
 
475 aa  770    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  100 
 
 
476 aa  986    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  75.88 
 
 
516 aa  758    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  84.24 
 
 
475 aa  826    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  66.19 
 
 
482 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  67.48 
 
 
483 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  67.48 
 
 
483 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  67.48 
 
 
483 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  67.48 
 
 
483 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  67.48 
 
 
483 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  67.28 
 
 
483 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  67.48 
 
 
483 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  64.68 
 
 
480 aa  628  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  66.53 
 
 
475 aa  628  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  66.26 
 
 
483 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  64.32 
 
 
475 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  64.32 
 
 
475 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  65.24 
 
 
483 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  63.86 
 
 
480 aa  619  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  65.43 
 
 
481 aa  616  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  65.18 
 
 
477 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  65.43 
 
 
481 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.053417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  65.02 
 
 
481 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  59.53 
 
 
473 aa  568  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  60.66 
 
 
480 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  58.9 
 
 
473 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  59.5 
 
 
476 aa  560  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  48.62 
 
 
461 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  47.36 
 
 
463 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  47.03 
 
 
460 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  47.47 
 
 
461 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  46.64 
 
 
461 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  46.5 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  47.15 
 
 
459 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  44.33 
 
 
469 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  44.75 
 
 
465 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  43.7 
 
 
468 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  43.79 
 
 
463 aa  376  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  45.15 
 
 
458 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  43.79 
 
 
463 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  44.12 
 
 
469 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  43.49 
 
 
469 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  44.44 
 
 
469 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  43.91 
 
 
469 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  44.12 
 
 
469 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  42.86 
 
 
471 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  45.15 
 
 
458 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  43.61 
 
 
469 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  43.91 
 
 
469 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  43.82 
 
 
469 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  42.16 
 
 
465 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  44.54 
 
 
469 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  44.82 
 
 
471 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  43.34 
 
 
467 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  42.19 
 
 
474 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  43.4 
 
 
469 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  42.49 
 
 
465 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  44.19 
 
 
471 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  44.56 
 
 
470 aa  360  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  45.34 
 
 
461 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  44.35 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  43.13 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  42.55 
 
 
472 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  44.92 
 
 
461 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  43.93 
 
 
470 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  42.41 
 
 
466 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  41.49 
 
 
463 aa  353  4e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  44.3 
 
 
470 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  42.77 
 
 
471 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  43.43 
 
 
461 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  40.64 
 
 
472 aa  349  7e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  41.74 
 
 
472 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  41.84 
 
 
453 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  40.67 
 
 
470 aa  348  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  42.19 
 
 
465 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  41.49 
 
 
472 aa  346  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  41.88 
 
 
465 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  41.1 
 
 
460 aa  345  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  40.89 
 
 
476 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  42.23 
 
 
465 aa  344  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  42.23 
 
 
470 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  39.96 
 
 
511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>