More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1807 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 255 aa  488  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  37.38 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  41.55 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  37.16 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.9 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  41.94 
 
 		 288 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.45 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  43.95 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  41.23 
 
 		 295 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  42.6 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.57 
 
 		 304 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.39 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  42.15 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.95 
 
 		 286 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.46 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.83 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  46.12 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  42.53 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.47 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  42.15 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.47 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  40.62 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.47 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.47 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  36.17 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  38.6 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.07 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.47 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  41.45 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.2 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  41.05 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  43.05 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  38.22 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  43.18 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  38.46 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.19 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  32.24 
 
 		 359 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  36.32 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  39.53 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  40 
 
 		 283 aa  131  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  42.86 
 
 		 283 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  43.17 
 
 		 286 aa  131  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.91 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  34.91 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40.18 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  41.1 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  39.39 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  41.56 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  34.7 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  36.7 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  41.4 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.55 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.06 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  34.06 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  29.63 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  41.28 
 
 		 294 aa  128  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.11 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  42.86 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  38.65 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  38.65 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  34.38 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  32.92 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.19 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  42.99 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  41.07 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  33.82 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.55 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  40.45 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  35.66 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.85 
 
 		 301 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  43.46 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  38.12 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  33.93 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.67 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  34.55 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.38 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  33.76 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  39.91 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  36.91 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.71 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.84 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  33.72 
 
 		 286 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  40.38 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  38.5 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03431  putative protein methyltransferase  32.74 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  40.09 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.09 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  40 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  37.71 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  34.93 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  41.28 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  37.39 
 
 		 281 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.21 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1695  modification methylase HemK  35.75 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.304101  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  36.86 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  38.74 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  33.18 
 
 		 281 aa  123  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.84 
 
 		 285 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  36.29 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>