More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1234 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  100 
 
 
318 aa  631  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  58.36 
 
 
346 aa  348  6e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  58.97 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4604  Pirin domain protein  53.36 
 
 
331 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0130352  hitchhiker  0.0000248585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  54.46 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  55.52 
 
 
322 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  54.14 
 
 
337 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  54.13 
 
 
328 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  52.58 
 
 
342 aa  312  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  52.96 
 
 
324 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  53.1 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  52.6 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  52.6 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  51.38 
 
 
323 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  50.16 
 
 
320 aa  296  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  48.94 
 
 
290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  49.29 
 
 
290 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  49.3 
 
 
292 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  48.58 
 
 
290 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  48.58 
 
 
337 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  48.94 
 
 
290 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  48.94 
 
 
290 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  48.58 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  48.58 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  48.58 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  48.58 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  48.58 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  48.58 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  48.23 
 
 
290 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  48.23 
 
 
290 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  45.83 
 
 
290 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  48.59 
 
 
292 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  42.24 
 
 
286 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  44.44 
 
 
290 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  42.7 
 
 
293 aa  202  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  40.77 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  40.77 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  40.77 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  40.42 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  39.72 
 
 
288 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  39.72 
 
 
288 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  42.46 
 
 
293 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  40.07 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  39.79 
 
 
290 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  40.85 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  40.66 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  41.81 
 
 
288 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  43.33 
 
 
287 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  35.29 
 
 
293 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  42.38 
 
 
305 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  40 
 
 
293 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  42.54 
 
 
286 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  38.29 
 
 
287 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  40.51 
 
 
289 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  40.51 
 
 
289 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  41.28 
 
 
282 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  40.51 
 
 
289 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  39.71 
 
 
288 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.79 
 
 
293 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  41.7 
 
 
286 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  43.38 
 
 
295 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  40.67 
 
 
286 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  40.41 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  40.36 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  38 
 
 
302 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  41.54 
 
 
293 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  41.18 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  40.7 
 
 
288 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  42.18 
 
 
288 aa  188  9e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  40.15 
 
 
292 aa  188  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  40.7 
 
 
288 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  40.7 
 
 
288 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  40.7 
 
 
288 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  40.7 
 
 
288 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  40.7 
 
 
288 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  40.7 
 
 
288 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  43.38 
 
 
295 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  40.73 
 
 
288 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  36.33 
 
 
302 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  39.34 
 
 
303 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  39.13 
 
 
303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  41.54 
 
 
285 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  36.07 
 
 
301 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  41.28 
 
 
286 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  37.62 
 
 
309 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  42.59 
 
 
295 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  37.29 
 
 
294 aa  185  8e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  39.3 
 
 
290 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  38.64 
 
 
287 aa  185  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  39.79 
 
 
288 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  37.94 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  36.46 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  39.42 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  40.14 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2491  Pirin domain protein  38.85 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  38.83 
 
 
289 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  40.66 
 
 
291 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0271  pirin family protein  38.68 
 
 
282 aa  182  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  42.34 
 
 
286 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>