More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2709 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  100 
 
 		 154 aa  306  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  72.22 
 
 		 161 aa  218  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  68.49 
 
 		 158 aa  210  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  64.15 
 
 		 159 aa  210  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  63.27 
 
 		 155 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  62.59 
 
 		 155 aa  200  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  62.09 
 
 		 155 aa  196  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  62.99 
 
 		 155 aa  187  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  60.71 
 
 		 152 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  60.71 
 
 		 152 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  56.2 
 
 		 152 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  52.45 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  47.92 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  43.51 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  44.14 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  44.14 
 
 		 156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  43.84 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  40 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  42.86 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  45.21 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  43.17 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  39.33 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  38.57 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  38.57 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  45.65 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  43.18 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.16 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.67 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  38.41 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  36.49 
 
 		 178 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  36.49 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.49 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  36.49 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  36.49 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  36.49 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  36.49 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  38.41 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  38.41 
 
 		 163 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 175 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  36.49 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  40.13 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  37.59 
 
 		 183 aa  116  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  37.75 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  35.81 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  44.37 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.21 
 
 		 164 aa  114  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  35.86 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  35.86 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  36.62 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  37.41 
 
 		 174 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  34.51 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  35.33 
 
 		 218 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  40 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  35.66 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  36.96 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  35.21 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  34.72 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  34.25 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  34.25 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  33.8 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.62 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  34.29 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  33.1 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  35.57 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  36.23 
 
 		 171 aa  104  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  35.04 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  33.8 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.92 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  37.32 
 
 		 179 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  32.88 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  36.76 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  32.19 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  33.33 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  32.19 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  32.17 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  32.19 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.19 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  33.56 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  32.19 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  36.24 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  31.03 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  35 
 
 		 183 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  35.42 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  33.99 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  33.99 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  32.86 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  32.86 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>