More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1761 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
435 aa  863    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  69.27 
 
 
436 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  62.14 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  60.56 
 
 
442 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  58.56 
 
 
457 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  56.94 
 
 
490 aa  415  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  56.71 
 
 
472 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  55.56 
 
 
472 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  56.64 
 
 
441 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  57.24 
 
 
471 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  55.94 
 
 
441 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  54.65 
 
 
474 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  51.98 
 
 
457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  54.63 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  56.79 
 
 
471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  56.79 
 
 
471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  57.87 
 
 
471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  57.21 
 
 
474 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  52.67 
 
 
465 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  53 
 
 
450 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  56.16 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  54.79 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  58.63 
 
 
415 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  54.92 
 
 
466 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  58.56 
 
 
457 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  57.98 
 
 
426 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  55.28 
 
 
461 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  56.33 
 
 
469 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  58.69 
 
 
459 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  56.45 
 
 
470 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  58.69 
 
 
434 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  55.61 
 
 
444 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  56.83 
 
 
442 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  58.44 
 
 
455 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  53.41 
 
 
447 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  54.77 
 
 
416 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  55.16 
 
 
432 aa  381  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  52.73 
 
 
435 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  56.44 
 
 
446 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  56.25 
 
 
448 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  51.9 
 
 
423 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  52.75 
 
 
435 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  49.04 
 
 
432 aa  322  6e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  47.44 
 
 
433 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  47.44 
 
 
433 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  48.36 
 
 
432 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  45.3 
 
 
414 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  45.3 
 
 
414 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  46.72 
 
 
441 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.5 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  46.72 
 
 
421 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.24 
 
 
429 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  46.37 
 
 
433 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  46.32 
 
 
440 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  47.25 
 
 
445 aa  279  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.96 
 
 
429 aa  278  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  49.57 
 
 
432 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  49.57 
 
 
432 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  46.59 
 
 
433 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.92 
 
 
441 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  46.59 
 
 
433 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  46.59 
 
 
433 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  45.04 
 
 
433 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.54 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  46.96 
 
 
417 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  44.71 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  44.48 
 
 
429 aa  273  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  44.66 
 
 
426 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  44.66 
 
 
426 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  44.66 
 
 
426 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  46.01 
 
 
450 aa  272  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  44.66 
 
 
426 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  44.66 
 
 
426 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.17 
 
 
422 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  45.67 
 
 
428 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  43.8 
 
 
454 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  42.93 
 
 
435 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  45.5 
 
 
426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  46.94 
 
 
439 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  52.73 
 
 
435 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  52.73 
 
 
435 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  43.03 
 
 
454 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  46.24 
 
 
426 aa  270  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  43.54 
 
 
454 aa  270  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  47.35 
 
 
435 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  46.53 
 
 
426 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 
450 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  43.72 
 
 
431 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  45.58 
 
 
441 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  45.41 
 
 
428 aa  269  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  45.41 
 
 
428 aa  269  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  44.11 
 
 
426 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  46.24 
 
 
426 aa  269  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  44.11 
 
 
426 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  44.11 
 
 
426 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  44.11 
 
 
426 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  44.11 
 
 
426 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  44.11 
 
 
426 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  44.11 
 
 
426 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  44.11 
 
 
426 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>