60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3999 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_3999  ATP-dependent Na+ efflux pump  100 
 
 
406 aa  797    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.241363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1807  ATP-dependent Na+ efflux pump  51.99 
 
 
432 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000010693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3474  ATP-dependent Na+ efflux pump  48.76 
 
 
430 aa  388  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1452  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.85 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.75331  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0771  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  27.55 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_756  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0135656  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0852  sodium extrusion protein NatB, putative  26.59 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1046  hypothetical protein  27.27 
 
 
429 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.75067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3327  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  24.33 
 
 
411 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.63317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2673  putative ABC-2 type transport system permease protein  23.32 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.270062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2039  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2404  hypothetical protein  25.83 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.398451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2425  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  24.39 
 
 
400 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  27.65 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  26.28 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4637  sodium export permease protein  27.84 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4244  hypothetical protein  27.84 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4966  ABC transporter, permease protein, putative  22.64 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3209  sodium export permease protein  25.89 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4337  ABC-2 type transport system permease protein  27.2 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1740  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  21.73 
 
 
441 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0699  hypothetical protein  26.69 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.513014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4022  ABC transporter, permease component, putative sodium exporter  21.81 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777499 
 
 
-
 
NC_002950  PG0945  ABC transporter, permease protein, putative  22.53 
 
 
442 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0199205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  26.18 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5048  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  23.13 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.626469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0486  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.91 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0618  sodium export permease protein  25.87 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0704  hypothetical protein  26.27 
 
 
403 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4617  sodium export permease protein  25.48 
 
 
408 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4635  hypothetical protein  28.05 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  21.72 
 
 
426 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  29.57 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4256  hypothetical protein  25.68 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.199751  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4621  hypothetical protein  25.68 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4744  hypothetical protein  25.68 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4404  hypothetical protein  25.68 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.43 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08266  ABC transporter, permease protein, putative  20.71 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4513  hypothetical protein  21.3 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.2961  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7296  hypothetical protein  23.04 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2743  ABC-type Na+ efflux pump permease component  26.75 
 
 
360 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.306664  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2558  hypothetical protein  24.02 
 
 
466 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.246034  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5257  hypothetical protein  24.56 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  25.57 
 
 
407 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  26.05 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0859  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  23.66 
 
 
368 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00918968  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  23.89 
 
 
412 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26820  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  28.63 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749324  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2674  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like  26.92 
 
 
428 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  22.51 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  22.51 
 
 
410 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4173  putative ABC transporter  25.21 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6163  ABC transporter permease  25.89 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19888  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1780  hypothetical protein  32.99 
 
 
353 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1794  hypothetical protein  29.17 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37432  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  21.45 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1059  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  22.69 
 
 
457 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.163235  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3030  putative Na+ efflux ABC transporter, permease component  24.89 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.509957  hitchhiker  0.000114076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>