81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2108 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.74 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  41.38 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5266  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  40.16 
 
 		 176 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3056  putative regulatory protein  34.53 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.23 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.3 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  39.81 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 		 251 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 		 295 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 		 1225 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  38.21 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  32.28 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.71 
 
 		 579 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  32.26 
 
 		 200 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  33.96 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  31.34 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3435  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0121254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 		 288 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  37.7 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  43.02 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.47 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  37.23 
 
 		 470 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.77 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4139  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  33.33 
 
 		 694 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5041  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.06 
 
 		 750 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  36.67 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  31.91 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0704  hypothetical protein  34.88 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 		 666 aa  43.9  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  34.34 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0713  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  39.53 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0305  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  36.89 
 
 		 365 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  32.28 
 
 		 713 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.48 
 
 		 693 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.56 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 1361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 487 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.64 
 
 		 688 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1306  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00486516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  37.5 
 
 		 753 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 159 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 142 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>