79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0028 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  620  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  57.62 
 
 
306 aa  332  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  56.95 
 
 
306 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  50.99 
 
 
312 aa  293  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  47.4 
 
 
307 aa  284  1e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  47.65 
 
 
329 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  49.33 
 
 
307 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  47.33 
 
 
330 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  48.04 
 
 
302 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  50.5 
 
 
315 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  50.17 
 
 
304 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  46.85 
 
 
334 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  46.85 
 
 
334 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  46.85 
 
 
334 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  50.72 
 
 
307 aa  265  6e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  46.43 
 
 
312 aa  264  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  47.67 
 
 
298 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  48.75 
 
 
304 aa  261  9e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  47.87 
 
 
314 aa  261  9e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  48 
 
 
311 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  47.04 
 
 
342 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  45.39 
 
 
301 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  46.56 
 
 
313 aa  255  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  44.92 
 
 
301 aa  254  1e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  48.24 
 
 
324 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  45.07 
 
 
311 aa  245  7e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  49.82 
 
 
316 aa  243  4e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  44.57 
 
 
311 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  43.41 
 
 
312 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  43.89 
 
 
319 aa  235  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  43.93 
 
 
310 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  40.58 
 
 
312 aa  220  2e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  40.86 
 
 
312 aa  216  3e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05047e-11 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  38.49 
 
 
348 aa  209  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  38.7 
 
 
325 aa  201  2e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  36.36 
 
 
353 aa  185  1e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  38.77 
 
 
318 aa  178  9e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  29.79 
 
 
299 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  29.37 
 
 
269 aa  108  9e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  28.01 
 
 
297 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  28.17 
 
 
284 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  28.07 
 
 
298 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.52 
 
 
290 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  29.03 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  28.32 
 
 
279 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  27.05 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  26.74 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  26.74 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  27.24 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  26.07 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  27.97 
 
 
282 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  28.03 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  26.55 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  24.64 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  1.6468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  23.26 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  27.59 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  27.24 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  25.62 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  26.74 
 
 
281 aa  84.7  2e-15  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  29.02 
 
 
286 aa  84.3  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  28.43 
 
 
283 aa  84  3e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  29.6 
 
 
284 aa  83.6  4e-15  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  25.43 
 
 
294 aa  83.6  4e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  25.89 
 
 
286 aa  81.6  1e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  26.22 
 
 
301 aa  81.6  2e-14  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  25.76 
 
 
283 aa  80.9  3e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  26.1 
 
 
316 aa  79.7  5e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  24.04 
 
 
289 aa  77.4  3e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  25.09 
 
 
286 aa  76.3  6e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  7.87132e-05  hitchhiker  7.05422e-05 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  25.17 
 
 
301 aa  76.3  7e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83665e-10 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  24.65 
 
 
301 aa  75.5  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  24.91 
 
 
289 aa  75.5  1e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  25.88 
 
 
302 aa  73.9  3e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  25.17 
 
 
306 aa  72.8  8e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  26.34 
 
 
296 aa  70.9  3e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  25.61 
 
 
286 aa  64.3  2e-09  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  25.42 
 
 
280 aa  61.6  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  24.49 
 
 
280 aa  57.8  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  29.06 
 
 
312 aa  49.7  6e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>