More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2930 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  100 
 
 
95 aa  193  7e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  50 
 
 
96 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  48.42 
 
 
95 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  45.26 
 
 
98 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  48.91 
 
 
95 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  47.83 
 
 
94 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 
95 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 
95 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 
95 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  42.86 
 
 
95 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
95 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  43.01 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  43.48 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  43.48 
 
 
95 aa  88.2  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 
125 aa  87.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  44.09 
 
 
127 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
95 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  44.94 
 
 
108 aa  85.9  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  42.39 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  48.86 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  43.48 
 
 
96 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 
98 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 
98 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  41.3 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  43.82 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  40 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  40.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  34.78 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  45.56 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  44.94 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  39.78 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  39.78 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  40 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  39.78 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  42.71 
 
 
97 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  38.95 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  40.22 
 
 
97 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  35.87 
 
 
98 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  36.96 
 
 
97 aa  77  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  38.04 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  41.57 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  41.57 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  36.17 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  37.36 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  42.7 
 
 
152 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  42.7 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  41.3 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  39.13 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  41.57 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  36.96 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  42.7 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>