216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2292 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2292  glycerate kinase  100 
 
 
389 aa  759    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  49.45 
 
 
383 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  46.63 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  45.8 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  44.2 
 
 
378 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  38.67 
 
 
380 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  46.77 
 
 
379 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  47.98 
 
 
381 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  46.77 
 
 
379 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2327  glycerate kinase  47.8 
 
 
389 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  43.24 
 
 
379 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  43.89 
 
 
380 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  43.35 
 
 
379 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1347  glycerate kinase  50.27 
 
 
381 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.067363  normal  0.0868647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5226  glycerate kinase  50.27 
 
 
381 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  43.4 
 
 
382 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  37.97 
 
 
384 aa  255  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  45.74 
 
 
381 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1843  glycerate kinase  50.13 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250112  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  42.02 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1948  glycerate kinase  50.13 
 
 
381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0679177  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1904  Glycerate kinase  48.25 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0448313  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1913  glycerate kinase  50.13 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.4386  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  43.01 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  44.27 
 
 
380 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  39.19 
 
 
380 aa  252  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  40.86 
 
 
381 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6154  glycerate kinase  49.6 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1925  glycerate kinase  49.6 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  46.63 
 
 
379 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  40.59 
 
 
381 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  40.59 
 
 
385 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  42.09 
 
 
379 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  42.4 
 
 
378 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  40.59 
 
 
381 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  40.84 
 
 
381 aa  249  8e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  44.68 
 
 
378 aa  249  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  42.13 
 
 
378 aa  248  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1009  glycerate kinase  48.25 
 
 
381 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516875  normal  0.67759 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1468  glycerate kinase 1  48.57 
 
 
387 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2484  glycerate kinase 1  48.57 
 
 
387 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  41.13 
 
 
380 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  41.87 
 
 
378 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2368  glycerate kinase  48.57 
 
 
387 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  38.48 
 
 
386 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  41.44 
 
 
384 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1961  glycerate kinase 1  48.69 
 
 
380 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3344  glycerate kinase 1  48.69 
 
 
380 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1235  glycerate kinase 1  48.69 
 
 
380 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.338815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  40.32 
 
 
385 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2298  glycerate kinase  47.17 
 
 
381 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  46.52 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  42.01 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  40.27 
 
 
380 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  46.52 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  46.13 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  42.2 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  46.52 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  41.33 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  38.44 
 
 
381 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  46.79 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  40 
 
 
377 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  43.94 
 
 
381 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  41.19 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  40.71 
 
 
387 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  41.19 
 
 
373 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  40.86 
 
 
381 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  47.71 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  42.62 
 
 
380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  42.13 
 
 
388 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  45.09 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  38.21 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  39.08 
 
 
379 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  39.08 
 
 
392 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  44.08 
 
 
385 aa  235  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  45.56 
 
 
353 aa  234  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  42.16 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  40.38 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  41.53 
 
 
380 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  43.05 
 
 
381 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  41.53 
 
 
380 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4561  glycerate kinase  40.74 
 
 
387 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.532738 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  38.42 
 
 
383 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  40 
 
 
382 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.27 
 
 
380 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  41.27 
 
 
380 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  40 
 
 
382 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  40.8 
 
 
382 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  40.8 
 
 
382 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  40.11 
 
 
380 aa  229  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.27 
 
 
380 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  40.32 
 
 
381 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  40.9 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2117  glycerate kinase 1  48.15 
 
 
518 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  41.26 
 
 
395 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  37.2 
 
 
381 aa  225  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2253  glycerate kinase  40.39 
 
 
380 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.453069  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24350  glycerate kinase  36.8 
 
 
376 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  39.15 
 
 
408 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  39.15 
 
 
408 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>