92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0828 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  731    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  79.49 
 
 		 351 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  81.42 
 
 		 352 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  78.29 
 
 		 352 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  77.65 
 
 		 353 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  77.08 
 
 		 353 aa  558  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  63.66 
 
 		 361 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  62.69 
 
 		 340 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  60.81 
 
 		 357 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  58.91 
 
 		 358 aa  401  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  57.51 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  56.42 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  54.9 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  54.12 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  57.63 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  52.45 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  53.23 
 
 		 334 aa  355  5e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  51.85 
 
 		 342 aa  349  3e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  54.66 
 
 		 331 aa  348  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  48.2 
 
 		 342 aa  343  2e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  50.46 
 
 		 350 aa  326  5e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  49.57 
 
 		 366 aa  322  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  49.51 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  46.2 
 
 		 342 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  47.24 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  43.99 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  45.66 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  45.31 
 
 		 333 aa  288  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  44.94 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  42.82 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  45.93 
 
 		 359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  45.86 
 
 		 354 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  43.75 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  43.17 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  43.17 
 
 		 345 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  44.16 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  46.73 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  44.77 
 
 		 338 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  45.63 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  44.9 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  41.12 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  46.23 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  46.15 
 
 		 337 aa  268  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  44.52 
 
 		 356 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  45.1 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  41.8 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  43.77 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  41.25 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  47.08 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  43.52 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  43.93 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  42.45 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  41.61 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  40.19 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  47.41 
 
 		 242 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  43.06 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  42.57 
 
 		 256 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  29.97 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  55.05 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  48.31 
 
 		 197 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  38.36 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  38.36 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  43.65 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  42.11 
 
 		 144 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  42.15 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  43.94 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  43.44 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  43.86 
 
 		 192 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  44.55 
 
 		 154 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  37.1 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  36.29 
 
 		 333 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  33.57 
 
 		 141 aa  93.2  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  34.59 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  52.38 
 
 		 105 aa  91.3  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  39.66 
 
 		 126 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  34.81 
 
 		 291 aa  86.3  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  39.45 
 
 		 127 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  34.07 
 
 		 198 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  33.93 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  32.03 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  34.62 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  34.62 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  32.76 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  27.13 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  31.52 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 90 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  29.58 
 
 		 108 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  35.29 
 
 		 81 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>