108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3185 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  98.58 
 
 
352 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
352 aa  666    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  95.11 
 
 
365 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  41.69 
 
 
351 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  41.57 
 
 
350 aa  252  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  41.13 
 
 
376 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  43.06 
 
 
348 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  43.77 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  34.78 
 
 
355 aa  213  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  38.48 
 
 
363 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  37.9 
 
 
351 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  37.9 
 
 
351 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  33.72 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  41.04 
 
 
343 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  36.89 
 
 
353 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  40 
 
 
352 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  39.13 
 
 
352 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  35.26 
 
 
324 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  31.43 
 
 
361 aa  96.3  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  33.14 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  29.83 
 
 
371 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  41.73 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  41.73 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  26.91 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0864  saccharopine dehydrogenase  28.3 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.109477  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  28.32 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  33.03 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  32.56 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  31.35 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  32.4 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  35.38 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  29.38 
 
 
408 aa  69.3  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  31.82 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  32.96 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  31.91 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 
427 aa  67  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  36.49 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  33.33 
 
 
404 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  32 
 
 
371 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  25.5 
 
 
432 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  34.93 
 
 
422 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  30.81 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  33.11 
 
 
418 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  30.2 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  31.69 
 
 
375 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  33.24 
 
 
378 aa  62.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  28.37 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  22.11 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  31.25 
 
 
391 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  31.8 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.45 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  32.69 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  33.8 
 
 
393 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  30.45 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  31.75 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  28.35 
 
 
410 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  35.21 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  31.43 
 
 
419 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  32.62 
 
 
430 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  23.61 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  33.8 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  36 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  31.52 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  32.89 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  29.17 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.03 
 
 
414 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  31.08 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  28.67 
 
 
419 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  28.67 
 
 
419 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  28.67 
 
 
419 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  28.17 
 
 
421 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  29.34 
 
 
391 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  32.58 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  28.11 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  27.78 
 
 
414 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  25.32 
 
 
413 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  26.75 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  30.28 
 
 
375 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  27.21 
 
 
502 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.08 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.46 
 
 
407 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  27.4 
 
 
416 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  27.4 
 
 
416 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.11 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  26.56 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  31.43 
 
 
421 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  28.47 
 
 
375 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  27.4 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  27.33 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  35.45 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.28 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  37.63 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.41 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 
430 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  28.65 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  28.65 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  31.65 
 
 
498 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>