More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0562 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  94.78 
 
 
400 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  99.5 
 
 
398 aa  781    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  100 
 
 
398 aa  785    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  59.6 
 
 
397 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  56.6 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  55.98 
 
 
394 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  56.78 
 
 
393 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  55.73 
 
 
398 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  56.27 
 
 
461 aa  433  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  51.27 
 
 
396 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 
395 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  46.67 
 
 
396 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
397 aa  362  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  44.9 
 
 
395 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  44.3 
 
 
393 aa  355  5e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  45.45 
 
 
396 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  44.64 
 
 
398 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  42.71 
 
 
397 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  44.13 
 
 
397 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  39.03 
 
 
397 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  44.13 
 
 
397 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  42.6 
 
 
398 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  39.59 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  42.6 
 
 
397 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 
398 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  39.29 
 
 
395 aa  305  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  41.6 
 
 
395 aa  273  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.47 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  41.25 
 
 
393 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  39.39 
 
 
393 aa  261  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  35.54 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  36.01 
 
 
405 aa  206  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  36.16 
 
 
389 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  34.24 
 
 
397 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  36.16 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  35.54 
 
 
389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  32.78 
 
 
404 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  36.98 
 
 
410 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2066  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 
400 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0959735  normal  0.858432 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  31.79 
 
 
377 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  31.79 
 
 
377 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  26.99 
 
 
403 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  30.39 
 
 
387 aa  160  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2116  aminotransferase class I and II  32.91 
 
 
400 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
397 aa  159  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0973  aminotransferase class I and II  29.33 
 
 
379 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  35.45 
 
 
396 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2206  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 
400 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  26.37 
 
 
375 aa  157  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1731  L-aspartate aminotransferase  32.66 
 
 
400 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
393 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  32.45 
 
 
404 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  34.32 
 
 
392 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  30 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  29.76 
 
 
389 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 
373 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  27.59 
 
 
385 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  28.37 
 
 
386 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  31.32 
 
 
396 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  29.04 
 
 
375 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
392 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  29.27 
 
 
376 aa  150  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  31.35 
 
 
380 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0746  aminotransferase class I and II  31.94 
 
 
387 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000316977  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  29.06 
 
 
375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  31.89 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3263  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 
382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1096  aspartate aminotransferase protein  31.51 
 
 
403 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.420388 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  30.59 
 
 
412 aa  147  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  28.49 
 
 
379 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  30.03 
 
 
387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.91 
 
 
390 aa  146  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1187  aminotransferase class I and II  30.36 
 
 
402 aa  146  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  29.13 
 
 
375 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1427  hypothetical protein  27.56 
 
 
402 aa  146  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0489615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  33.7 
 
 
393 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  30.89 
 
 
381 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 
388 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  29.84 
 
 
375 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  27.5 
 
 
373 aa  145  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  28.69 
 
 
382 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  29.92 
 
 
380 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 
385 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1014  aminotransferase  29.53 
 
 
402 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.89 
 
 
404 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  30.29 
 
 
396 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  29.2 
 
 
395 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  30.79 
 
 
413 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  28.73 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  28.73 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  30.96 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  28.53 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  29 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  29.79 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  28.8 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 
401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>