92 genes were found for organism Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tpau_4244  CDS  NC_014159  823  1935  -  1113  HTTM domain protein  YP_003649151  normal  0.232195  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4245  CDS  NC_014159  1929  2570  -  642  hypothetical protein  YP_003649152  normal  0.284195  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4246  CDS  NC_014159  2563  3234  -  672  hypothetical protein  YP_003649153  normal  0.120541  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4247  CDS  NC_014159  3454  3741  +  288  hypothetical protein  YP_003649154  normal  0.0181651  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4248  CDS  NC_014159  3744  4061  +  318  transcriptional regulator, CopG family  YP_003649155  normal  0.0175241  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4249  CDS  NC_014159  4107  4478  +  372  hypothetical protein  YP_003649156  normal  0.0628152  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4250  CDS  NC_014159  4960  5262  +  303  Abortive infection protein  YP_003649157  normal  0.229535  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4251  CDS  NC_014159  5292  5924  -  633  hypothetical protein  YP_003649158  normal  0.139204  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4252  CDS  NC_014159  5938  6675  -  738  hypothetical protein  YP_003649159  normal  0.0626578  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4253  CDS  NC_014159  6672  7700  -  1029  permease  YP_003649160  normal  0.261414  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4254  CDS  NC_014159  7731  8051  -  321  hypothetical protein  YP_003649161  normal  0.221605  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4255  CDS  NC_014159  8051  8527  -  477  hypothetical protein  YP_003649162  normal  0.751025  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4256  CDS  NC_014159  9354  12434  +  3081  TrwC relaxase  YP_003649163  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4257    NC_014159  12550  12906  +  357      normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4258    NC_014159  13134  13361  -  228      normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4259  CDS  NC_014159  13384  13950  +  567  hypothetical protein  YP_003649164  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4260  CDS  NC_014159  14005  14316  +  312  hypothetical protein  YP_003649165  normal  0.98704  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4261  CDS  NC_014159  14340  14921  +  582  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_003649166  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4262  CDS  NC_014159  14918  15145  +  228  hypothetical protein  YP_003649167  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4263  CDS  NC_014159  15252  15629  -  378  hypothetical protein  YP_003649168  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4264  CDS  NC_014159  16036  16161  +  126  hypothetical protein  YP_003649169  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4265  CDS  NC_014159  16260  16889  -  630  hypothetical protein  YP_003649170  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4266  CDS  NC_014159  17015  17683  -  669  hypothetical protein  YP_003649171  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4267  CDS  NC_014159  17742  17987  -  246  hypothetical protein  YP_003649172  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4268  CDS  NC_014159  18195  19481  +  1287  transposase mutator type  YP_003649173  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4269  CDS  NC_014159  19904  21115  +  1212  transposase IS111A/IS1328/IS1533  YP_003649174  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4270  CDS  NC_014159  21341  22333  +  993  hypothetical protein  YP_003649175  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4271  CDS  NC_014159  22330  24063  +  1734  cell division FtsK/SpoIIIE  YP_003649176  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4272  CDS  NC_014159  24158  25690  +  1533  Integrase catalytic region  YP_003649177  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4273  CDS  NC_014159  25690  26481  +  792  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_003649178  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4274  CDS  NC_014159  26591  26869  +  279  glutaredoxin-like protein NrdH  YP_003649179  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4275  CDS  NC_014159  26910  27536  +  627  replicative DNA helicase  YP_003649180  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4276  CDS  NC_014159  27745  29055  +  1311  transposase mutator type  YP_003649181  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4277  CDS  NC_014159  29092  29868  +  777  hypothetical protein  YP_003649182  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4278  CDS  NC_014159  31111  31785  +  675  hypothetical protein  YP_003649183  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4279  CDS  NC_014159  31801  32280  +  480  hypothetical protein  YP_003649184  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4280  CDS  NC_014159  32315  33106  +  792  hypothetical protein  YP_003649185  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4281  CDS  NC_014159  33109  34263  -  1155  hypothetical protein  YP_003649186  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4282  CDS  NC_014159  34273  34770  -  498  hypothetical protein  YP_003649187  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4283  CDS  NC_014159  35417  37513  +  2097  hypothetical protein  YP_003649188  normal  0.607291  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4284  CDS  NC_014159  37920  39206  +  1287  transposase mutator type  YP_003649189  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4285  CDS  NC_014159  39837  40613  -  777  hypothetical protein  YP_003649190  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4286  CDS  NC_014159  40650  41960  -  1311  transposase mutator type  YP_003649191  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4287  CDS  NC_014159  42086  43372  -  1287  transposase mutator type  YP_003649192  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4288  CDS  NC_014159  43536  44516  -  981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_003649193  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4289  CDS  NC_014159  44545  45243  +  699  Abortive infection protein  YP_003649194  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4290  CDS  NC_014159  45265  46644  -  1380  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  YP_003649195  normal  0.61093  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4291  CDS  NC_014159  46659  48110  -  1452  hypothetical protein  YP_003649196  normal  0.814822  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4292  CDS  NC_014159  48092  49186  -  1095  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  YP_003649197  normal  0.713465  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4293  CDS  NC_014159  49646  51019  -  1374  hypothetical protein  YP_003649198  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4294  CDS  NC_014159  51276  51626  +  351  hypothetical protein  YP_003649199  normal  0.243402  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4295  CDS  NC_014159  51999  52796  +  798  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_003649200  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4296  CDS  NC_014159  52809  53156  +  348  hypothetical protein  YP_003649201  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4297  CDS  NC_014159  53695  54879  +  1185  integrase family protein  YP_003649202  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4298  CDS  NC_014159  54876  55859  +  984  putative recombinase  YP_003649203  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4299  CDS  NC_014159  56220  56417  +  198  hypothetical protein  YP_003649204  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4300  CDS  NC_014159  56414  56809  +  396  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_003649205  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4301  CDS  NC_014159  57070  57246  +  177  hypothetical protein  YP_003649206  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4302  CDS  NC_014159  57715  58137  +  423  hypothetical protein  YP_003649207  normal  0.446997  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4303  CDS  NC_014159  58257  59033  -  777  hypothetical protein  YP_003649208  normal  0.304014  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4304  CDS  NC_014159  59070  60380  -  1311  transposase mutator type  YP_003649209  normal  0.26589  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4305    NC_014159  60688  60846  +  159      normal  0.154054  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4306  CDS  NC_014159  61126  62634  +  1509  sulphate transporter  YP_003649210  normal  0.0228312  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4307  CDS  NC_014159  62645  63070  +  426  transcriptional regulator, MerR family  YP_003649211  decreased coverage  0.00729055  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4308  CDS  NC_014159  63125  63712  -  588  transcriptional regulator, TetR family  YP_003649212  normal  0.0100295  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4309    NC_014159  63799  63945  +  147      normal  0.0341723  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4310    NC_014159  64050  65760  +  1711      normal  0.0997225  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4311    NC_014159  65787  66263  +  477      normal  0.191734  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4312  CDS  NC_014159  66299  66928  -  630  hypothetical protein  YP_003649213  normal  0.362058  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4313    NC_014159  67292  68646  -  1355      normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4314  CDS  NC_014159  68689  68877  +  189  hypothetical protein  YP_003649214  normal  0.696536  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4315  CDS  NC_014159  68915  69733  -  819  hypothetical protein  YP_003649215  normal  0.356947  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4316  CDS  NC_014159  69730  70494  -  765  ABC transporter related protein  YP_003649216  normal  0.991603  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4317  CDS  NC_014159  70504  70986  -  483  hypothetical protein  YP_003649217  normal  0.343681  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4318  CDS  NC_014159  71073  71243  -  171  MbtH domain protein  YP_003649218  normal  0.165789  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4319  CDS  NC_014159  71248  75429  -  4182  amino acid adenylation domain protein  YP_003649219  normal  0.202034  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4320  CDS  NC_014159  75429  80390  -  4962  amino acid adenylation domain protein  YP_003649220  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4321  CDS  NC_014159  80430  83558  -  3129  Acyl transferase  YP_003649221  normal  0.113206  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4322  CDS  NC_014159  83555  84856  -  1302  Beta-ketoacyl synthase  YP_003649222  normal  0.829615  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4323  CDS  NC_014159  84853  85602  -  750  Thioesterase  YP_003649223  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4324  CDS  NC_014159  85689  86306  +  618  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  YP_003649224  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4325  CDS  NC_014159  86281  87624  -  1344  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  YP_003649225  normal  0.809623  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4326  CDS  NC_014159  87621  91112  -  3492  amino acid adenylation domain protein  YP_003649226  normal  0.380078  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4327  CDS  NC_014159  91148  91966  -  819  ABC-2 type transporter  YP_003649227  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4328  CDS  NC_014159  91963  92742  -  780  ABC-2 type transporter  YP_003649228  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4329  CDS  NC_014159  92739  93680  -  942  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  YP_003649229  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4330  CDS  NC_014159  93677  95011  -  1335  salicylate synthase  YP_003649230  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4331  CDS  NC_014159  95049  96701  +  1653  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003649231  normal  1  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4332  CDS  NC_014159  96949  97092  +  144  hypothetical protein  YP_003649232  normal  0.331656  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4333  CDS  NC_014159  97245  97451  -  207  hypothetical protein  YP_003649233  normal  0.215113  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4334  CDS  NC_014159  97524  98861  -  1338  hypothetical protein  YP_003649234  normal  0.163253  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Tpau_4335  CDS  NC_014159  98872  99756  -  885  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  YP_003649235  normal  0.0594008  n/a    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>