15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4310 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0221  transposase  87.39 
 
 
1698 bp  1392    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  87.39 
 
 
1698 bp  1392    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3013    87.39 
 
 
5762 bp  1392    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  87.39 
 
 
1698 bp  1392    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  87.39 
 
 
1698 bp  1392    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4310    100 
 
 
1711 bp  3392    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0997225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  80.37 
 
 
1677 bp  93.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  86.67 
 
 
1755 bp  83.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  89.86 
 
 
1695 bp  81.8  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  89.83 
 
 
1530 bp  69.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0425    92.11 
 
 
3175 bp  52  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  92.11 
 
 
1620 bp  52  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  92.11 
 
 
1671 bp  52  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  92.11 
 
 
1668 bp  52  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1873  short chain dehydrogenase  96.43 
 
 
753 bp  48.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.076245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>