3982 genes were found for organism Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bind_0001  CDS  NC_010581  271  264  30S ribosomal protein S20  YP_001831149  hitchhiker  0.00020529  normal  0.124488  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0002  CDS  NC_010581  413  748  336  hypothetical protein  YP_001831150  hitchhiker  0.000256779  normal  0.127689  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0003  CDS  NC_010581  1509  3041  1533  chromosomal replication initiation protein  YP_001831151  unclonable  2.44231e-08  normal  0.247706  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0004  CDS  NC_010581  3144  3671  528  Holliday junction resolvase  YP_001831152  hitchhiker  2.81167e-06  normal  0.194479  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0005  CDS  NC_010581  3668  4285  618  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_001831153  hitchhiker  3.54643e-06  normal  0.191603  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0006  CDS  NC_010581  4319  5377  1059  putative DNA-binding/iron metalloprotein/AP endonuclease  YP_001831154  hitchhiker  1.12127e-05  normal  0.576524  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0007  CDS  NC_010581  5533  6546  1014  porphobilinogen deaminase  YP_001831155  hitchhiker  0.000143071  normal  0.582224  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0008  CDS  NC_010581  6552  7292  741  uroporphyrinogen III synthase HEM4  YP_001831156  hitchhiker  0.000296597  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0009  CDS  NC_010581  7307  8101  795  ABC transporter related  YP_001831157  hitchhiker  0.0065566  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0010  CDS  NC_010581  8098  8931  834  ABC-2 type transporter  YP_001831158  normal  0.0265688  normal  0.974707  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0011  CDS  NC_010581  8947  9345  399  cytochrome c class I  YP_001831159  normal  0.0553485  normal  0.905582  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0012  CDS  NC_010581  9744  10217  474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001831160  normal  0.159452  normal  0.697351  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0013  CDS  NC_010581  10660  14382  3723  hypothetical protein  YP_001831161  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0014  CDS  NC_010581  14538  16481  1944  phosphoesterase  YP_001831162  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0015  CDS  NC_010581  16797  18278  1482  hypothetical protein  YP_001831163  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0016  CDS  NC_010581  18360  19787  1428  aldehyde dehydrogenase  YP_001831164  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0017  CDS  NC_010581  19888  20514  627  TetR family transcriptional regulator  YP_001831165  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0018  CDS  NC_010581  20652  21485  834  hypothetical protein  YP_001831166  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0019  CDS  NC_010581  21485  22681  1197  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  YP_001831167  normal  0.806782  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0020  CDS  NC_010581  22725  23990  1266  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_001831168  normal  0.59277  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0021  CDS  NC_010581  24079  25302  1224  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  YP_001831169  normal  0.715843  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0022  CDS  NC_010581  25411  25632  222  hypothetical protein  YP_001831170  normal  0.823634  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0023  CDS  NC_010581  25723  26049  327  hypothetical protein  YP_001831171  normal  0.919727  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0024  CDS  NC_010581  26639  27619  981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001831172  normal  0.235622  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0025  CDS  NC_010581  27769  28857  1089  glycosyl transferase family protein  YP_001831173  normal  0.245146  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0026  CDS  NC_010581  29298  29627  330  hypothetical protein  YP_001831174  normal  0.282024  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0027  CDS  NC_010581  29947  30522  576  TetR family transcriptional regulator  YP_001831175  normal  0.192036  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0028  CDS  NC_010581  30519  31511  993  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  YP_001831176  normal  0.170519  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0029  CDS  NC_010581  31894  32730  837  short chain dehydrogenase  YP_001831177  normal  0.148269  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0030  CDS  NC_010581  32743  33768  1026  AraC family transcriptional regulator  YP_001831178  normal  0.0645159  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0031  CDS  NC_010581  33829  34503  675  hypothetical protein  YP_001831179  normal  0.119247  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0032  CDS  NC_010581  34593  35495  903  short chain dehydrogenase  YP_001831180  normal  0.249754  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0033  CDS  NC_010581  35593  36258  666  TetR family transcriptional regulator  YP_001831181  normal  0.228128  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0034  CDS  NC_010581  36650  37558  909  alpha/beta hydrolase fold  YP_001831182  normal  0.0686733  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0035  CDS  NC_010581  37555  38016  462  hypothetical protein  YP_001831183  normal  0.0711061  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0036  CDS  NC_010581  38013  38675  663  hypothetical protein  YP_001831184  normal  0.138505  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0037  CDS  NC_010581  39217  40068  852  short chain dehydrogenase  YP_001831185  normal  0.40951  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0038  CDS  NC_010581  40125  40589  465  putative signal peptide protein  YP_001831186  normal  0.274459  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0039  CDS  NC_010581  40669  40974  306  hypothetical protein  YP_001831187  normal  0.243638  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0040  CDS  NC_010581  41211  42062  852  short chain dehydrogenase  YP_001831188  normal  0.262261  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0041  CDS  NC_010581  42077  43486  1410  aldehyde dehydrogenase  YP_001831189  normal  0.267288  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0042  CDS  NC_010581  43489  44523  1035  AraC family transcriptional regulator  YP_001831190  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0043  CDS  NC_010581  44583  45068  486  hypothetical protein  YP_001831191  normal  0.895981  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0044  CDS  NC_010581  45089  45247  159  hypothetical protein  YP_001831192  normal  0.676851  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0045  CDS  NC_010581  45890  46147  258  hypothetical protein  YP_001831193  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0046  CDS  NC_010581  46376  46528  153  hypothetical protein  YP_001831194  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0047  CDS  NC_010581  46724  48316  1593  isocitrate lyase  YP_001831195  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0048  CDS  NC_010581  48563  50029  1467  XRE family transcriptional regulator  YP_001831196  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0049  CDS  NC_010581  50242  50538  297  hypothetical protein  YP_001831197  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0050  CDS  NC_010581  50754  52025  1272  diaminopimelate decarboxylase  YP_001831198  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0051  CDS  NC_010581  52060  54639  2580  hypothetical protein  YP_001831199  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0052  CDS  NC_010581  54725  55258  534  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001831200  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0053  CDS  NC_010581  55508  57445  1938  acetyl-CoA synthetase  YP_001831201  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0054  CDS  NC_010581  57445  57657  213  hypothetical protein  YP_001831202  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0055  CDS  NC_010581  58350  59234  885  LysR family transcriptional regulator  YP_001831203  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0056  CDS  NC_010581  59373  60353  981  thioredoxin reductase  YP_001831204  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0057  CDS  NC_010581  60563  61072  510  hypothetical protein  YP_001831205  normal  0.822764  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0058  CDS  NC_010581  61410  61811  402  GtrA family protein  YP_001831206  normal  0.835752  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0059  CDS  NC_010581  61823  62071  249  hypothetical protein  YP_001831207  normal  0.980786  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0060  CDS  NC_010581  62473  63378  906  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001831208  normal  0.889116  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0061  CDS  NC_010581  63730  64293  564  TetR family transcriptional regulator  YP_001831209  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0062  CDS  NC_010581  64407  65102  696  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001831210  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0063  CDS  NC_010581  65496  67340  1845  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_001831211  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0064  CDS  NC_010581  67663  67932  270  hypothetical protein  YP_001831212  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0065  CDS  NC_010581  68109  69485  1377  ethanolamine ammonia lyase large subunit  YP_001831213  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0066  CDS  NC_010581  69482  70237  756  ethanolamine ammonia-lyase  YP_001831214  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0067  CDS  NC_010581  70335  70622  288  hypothetical protein  YP_001831215  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0068  CDS  NC_010581  70630  71103  474  hypothetical protein  YP_001831216  normal  0.721927  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0069  CDS  NC_010581  71133  71771  639  hypothetical protein  YP_001831217  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0070  CDS  NC_010581  71849  73807  1959  sulfate adenylyltransferase, large subunit  YP_001831218  normal  0.972692  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0071  CDS  NC_010581  73807  74715  909  sulfate adenylyltransferase subunit 2  YP_001831219  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0072  CDS  NC_010581  74925  76265  1341  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001831220  normal  normal  0.49786  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0073  CDS  NC_010581  76589  79420  2832  outer membrane autotransporter  YP_001831221  normal  normal  0.475524  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0074  CDS  NC_010581  80216  83644  3429  helicase domain-containing protein  YP_001831222  normal  0.313294  normal  0.416773  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0075  CDS  NC_010581  84000  84200  201  hypothetical protein  YP_001831223  normal  0.398237  normal  0.423709  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0076  CDS  NC_010581  84190  85686  1497  Na+/solute symporter  YP_001831224  normal  0.470505  normal  0.586357  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0077  CDS  NC_010581  86073  86612  540  hypothetical protein  YP_001831225  normal  0.100196  normal  0.541745  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0078  CDS  NC_010581  86726  86947  222  hypothetical protein  YP_001831226  normal  0.546204  normal  0.935994  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0079  CDS  NC_010581  87352  88554  1203  aminotransferase class I and II  YP_001831227  normal  0.940118  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0080  CDS  NC_010581  88607  90139  1533  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001831228  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0081  CDS  NC_010581  90246  91397  1152  high-affinity nickel-transporter  YP_001831229  normal  normal  0.940198  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0082  CDS  NC_010581  91491  92222  732  hypothetical protein  YP_001831230  normal  0.663458  normal  0.855004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0083  CDS  NC_010581  92599  96162  3564  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  YP_001831231  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0084  CDS  NC_010581  96172  96708  537  globin  YP_001831232  normal  0.719936  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0085  CDS  NC_010581  97040  97165  126  ribosomal protein L36  YP_001831233  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0086  CDS  NC_010581  97256  98179  924  TPR repeat-containing protein  YP_001831234  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0087  CDS  NC_010581  98679  100817  2139  glycosyl transferase  YP_001831235  normal  0.533314  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0088  CDS  NC_010581  101066  101818  753  glycosyl transferase family protein  YP_001831236  normal  normal  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0089  CDS  NC_010581  102176  103288  1113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001831237  normal  normal  0.789966  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0090  CDS  NC_010581  103285  104181  897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001831238  normal  normal  0.698259  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0091  CDS  NC_010581  104195  104758  564  hypothetical protein  YP_001831239  normal  normal  0.657028  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0092  CDS  NC_010581  104888  105544  657  peptide methionine sulfoxide reductase  YP_001831240  normal  normal  0.489685  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0093  CDS  NC_010581  105955  106665  711  hypothetical protein  YP_001831241  normal  normal  0.521548  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0094  CDS  NC_010581  106869  107210  342  hypothetical protein  YP_001831242  normal  normal  0.499336  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0095  CDS  NC_010581  107644  108300  657  intracellular septation protein A  YP_001831243  normal  normal  0.695813  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0096  CDS  NC_010581  108409  109101  693  hypothetical protein  YP_001831244  normal  0.596881  normal  0.945434  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0097  CDS  NC_010581  109805  110986  1182  aminotransferase class V  YP_001831245  normal  normal  0.765035  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0098  CDS  NC_010581  111090  112610  1521  FeS assembly protein SufB  YP_001831246  normal  normal  0.782387  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0099  CDS  NC_010581  112922  113677  756  FeS assembly ATPase SufC  YP_001831247  normal  normal  0.842965  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Bind_0100  CDS  NC_010581  113704  115038  1335  FeS assembly protein SufD  YP_001831248  normal  normal  0.993052  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>