21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0026 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  216  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  66.06 
 
 
109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  64.22 
 
 
135 aa  143  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4361  hypothetical protein  64.22 
 
 
109 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  38.18 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  36.36 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  30.91 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  33.64 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  32.73 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  34.23 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  31.82 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  31.82 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.03 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.16 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1143  hypothetical protein  34.29 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  28.44 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  32.29 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  25.69 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  28.09 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  32.53 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  26.36 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>