3189 genes were found for organism Burkholderia sp. 383



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcep18194_B0001  CDS  NC_007511  38  1057  1020  Phage integrase  YP_370762  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0002  CDS  NC_007511  1194  2375  1182  hypothetical protein  YP_370763  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0003  CDS  NC_007511  4197  5564  1368  hypothetical protein  YP_370764  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0004  CDS  NC_007511  5655  6716  1062  ParB family protein  YP_370765  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0005  CDS  NC_007511  6740  7402  663  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_370766  normal  0.22447  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0006  CDS  NC_007511  8493  8852  360  arsenate reductase  YP_370767  hitchhiker  0.0000819049  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0007  CDS  NC_007511  8940  9161  222  hypothetical protein  YP_370768  hitchhiker  0.000000132585  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0008  CDS  NC_007511  9139  9738  600  RNA polymerase sigma factor  YP_370769  hitchhiker  0.0000000310546  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0009  CDS  NC_007511  10106  10660  555  NADPH-dependent FMN reductase  YP_370770  hitchhiker  0.000000000508373  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0010  CDS  NC_007511  10713  13007  2295  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  YP_370771  hitchhiker  0.00266104  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0011  CDS  NC_007511  13080  13421  342  hypothetical protein  YP_370772  normal  0.0637571  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0012  CDS  NC_007511  13442  13810  369  response regulator receiver protein  YP_370773  normal  0.0723201  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0013  CDS  NC_007511  13794  14429  636  CheC, inhibitor of MCP methylation  YP_370774  normal  0.412046  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0014  CDS  NC_007511  14426  15364  939  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_370775  normal  0.927772  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0015  CDS  NC_007511  15434  16318  885  esterase  YP_370776  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0016  CDS  NC_007511  16494  16826  333  hypothetical protein  YP_370777  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0017  CDS  NC_007511  17086  17934  849  squalene/phytoene synthase  YP_370778  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0018  CDS  NC_007511  17948  19201  1254  amine oxidase  YP_370779  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0019  CDS  NC_007511  19213  21186  1974  Terpene synthase/squalene cyclase  YP_370780  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0020  CDS  NC_007511  21190  21894  705  hypothetical protein  YP_370781  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0021  CDS  NC_007511  22020  23009  990  VacJ-like lipoprotein  YP_370782  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0022  CDS  NC_007511  23002  25635  2634  RND efflux transporter  YP_370783  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0023  CDS  NC_007511  25959  26555  597  toluene tolerance protein  YP_370784  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0024  CDS  NC_007511  26636  27274  639  TetR family transcriptional regulator  YP_370785  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0025  CDS  NC_007511  27419  28939  1521  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_370786  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0026  CDS  NC_007511  28998  29642  645  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_370787  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0027  CDS  NC_007511  29672  31057  1386  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_370788  normal  normal  0.755533  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0028  CDS  NC_007511  31219  32802  1584  diguanylate cyclase  YP_370789  normal  normal  0.789293  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0029  CDS  NC_007511  33311  35485  2175  malate synthase G  YP_370790  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0030  CDS  NC_007511  35529  35933  405  hypothetical protein  YP_370791  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0031  CDS  NC_007511  35954  37174  1221  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  YP_370792  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0032  CDS  NC_007511  37199  38275  1077  glycolate oxidase FAD binding subunit  YP_370793  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0033  CDS  NC_007511  38275  39774  1500  glycolate oxidase subunit GlcD  YP_370794  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0034  CDS  NC_007511  39994  40764  771  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  YP_370795  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0035  CDS  NC_007511  40978  41481  504  hypothetical protein  YP_370796  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0036  CDS  NC_007511  41587  42609  1023  hypothetical protein  YP_370797  normal  0.740999  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0037  CDS  NC_007511  42966  43607  642  GntR family transcriptional regulator  YP_370798  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0038  CDS  NC_007511  43727  44215  489  OsmC-like protein  YP_370799  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0039  CDS  NC_007511  44232  44888  657  glutathione S-transferase-like protein  YP_370800  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0040  CDS  NC_007511  44992  45942  951  LysR family transcriptional regulator  YP_370801  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0041  CDS  NC_007511  46057  47808  1752  dihydroxy-acid dehydratase  YP_370802  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0042  CDS  NC_007511  47912  48841  930  2-dehydro-3-deoxy-L-arabinonate dehydratase  YP_370803  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0043  CDS  NC_007511  48889  49818  930  L-arabinose 1-dehydrogenase (NADP+)  YP_370804  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0044  CDS  NC_007511  49893  50906  1014  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_370805  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0045  CDS  NC_007511  50741  53608  2868  hypothetical protein  YP_370806  normal  0.0568399  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0046  CDS  NC_007511  50927  52495  1569  L-arabinose transporter ATP-binding protein  YP_370807  normal  0.54995  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0047  CDS  NC_007511  52529  53548  1020  L-arabinose transporter permease protein  YP_370808  normal  0.149615  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0048  CDS  NC_007511  53594  54496  903  L-arabinonolactonase  YP_370809  normal  0.21615  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0049  CDS  NC_007511  54669  55172  504  MarR family transcriptional regulator  YP_370810  normal  0.157141  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0050  CDS  NC_007511  55393  56223  831  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  YP_370811  normal  0.311743  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0051  CDS  NC_007511  56261  57709  1449  aldehyde dehydrogenase  YP_370812  normal  0.0422241  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0052  CDS  NC_007511  57721  59619  1899  feruloyl-CoA synthase  YP_370813  normal  0.423977  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0053  CDS  NC_007511  59823  61028  1206  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  YP_370814  normal  0.654425  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0054  CDS  NC_007511  61092  62240  1149  outer membrane protein (porin)  YP_370815  normal  0.914863  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0055  CDS  NC_007511  62269  63990  1722  feruloyl esterase  YP_370816  normal  0.980773  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0056  CDS  NC_007511  64062  64538  477  AsnC family transcriptional regulator  YP_370817  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0057  CDS  NC_007511  64697  65929  1233  diaminopropionate ammonia-lyase  YP_370818  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0058  CDS  NC_007511  65989  67164  1176  peptidase M20D, amidohydrolase  YP_370819  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0059  CDS  NC_007511  67569  68129  561  hypothetical protein  YP_370820  normal  0.39968  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0060  CDS  NC_007511  68217  69575  1359  aminotransferase  YP_370821  normal  0.568927  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0061  CDS  NC_007511  69872  70381  510  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_370822  normal  0.86654  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0062  CDS  NC_007511  70517  71152  636  transcriptional regulator  YP_370823  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0063  CDS  NC_007511  71449  71802  354  endoribonuclease L-PSP  YP_370824  normal  0.819868  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0064  CDS  NC_007511  71834  73084  1251  FAD dependent oxidoreductase  YP_370825  normal  0.711671  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0065  CDS  NC_007511  73191  74582  1392  amino acid transporter  YP_370826  normal  0.38933  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0066  CDS  NC_007511  74809  75459  651  outer membrane lipoprotein  YP_370827  normal  0.647379  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0067  CDS  NC_007511  75924  77123  1200  cytosine deaminase  YP_370828  normal  0.811575  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0068  CDS  NC_007511  77208  78392  1185  cytosine deaminase  YP_370829  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0069  CDS  NC_007511  78461  78934  474  hypothetical protein  YP_370830  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0070  CDS  NC_007511  79048  79908  861  LysR family transcriptional regulator  YP_370831  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0071  CDS  NC_007511  80094  80768  675  ankyrin repeat-containing protein  YP_370832  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0072  CDS  NC_007511  80796  81275  480  XRE family transcriptional regulator  YP_370833  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0073  CDS  NC_007511  81765  82568  804  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_370834  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0074  CDS  NC_007511  82600  83448  849  phytanoyl-CoA dioxygenase  YP_370835  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0075  CDS  NC_007511  83532  84269  738  histidine utilization repressor  YP_370836  normal  0.510846  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0076  CDS  NC_007511  84300  84842  543  XRE family transcriptional regulator  YP_370837  normal  0.196991  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0077  CDS  NC_007511  84977  85759  783  class II aldolase/adducin domain protein  YP_370838  normal  0.0421444  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0078  CDS  NC_007511  85810  86706  897  dihydrodipicolinate synthase  YP_370839  decreased coverage  0.00671629  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0079  CDS  NC_007511  86703  87410  708  MOSC family protein  YP_370840  normal  0.0138915  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0080  CDS  NC_007511  87432  88196  765  short chain dehydrogenase  YP_370841  normal  0.104238  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0081  CDS  NC_007511  88578  89285  708  hypothetical protein  YP_370842  normal  normal  0.868597  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0082  CDS  NC_007511  89375  90643  1269  hypothetical protein  YP_370843  normal  0.895639  normal  0.627542  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0083  CDS  NC_007511  90643  91065  423  hypothetical protein  YP_370844  normal  normal  0.54605  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0084  CDS  NC_007511  91095  91805  711  hypothetical protein  YP_370845  normal  normal  0.595349  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0085  CDS  NC_007511  92050  93366  1317  triacylglycerol lipase  YP_370846  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0086  CDS  NC_007511  93560  94690  1131  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_370847  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0087  CDS  NC_007511  94707  95681  975  hypothetical protein  YP_370848  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0088  CDS  NC_007511  95856  96284  429  hypothetical protein  YP_370849  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0089  CDS  NC_007511  96340  96855  516  OsmC-like protein  YP_370850  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0090  CDS  NC_007511  96881  97636  756  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_370851  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0091  CDS  NC_007511  97842  98903  1062  LysR family transcriptional regulator  YP_370852  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0092  CDS  NC_007511  98966  99370  405  hypothetical protein  YP_370853  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0093  CDS  NC_007511  99447  99926  480  alkylhydroperoxidase AhpD core  YP_370854  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0094  CDS  NC_007511  100133  101017  885  sigma-24 (FecI-like)  YP_370855  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0095  CDS  NC_007511  101014  101814  801  diaminopimelate epimerase  YP_370856  normal  normal  0.567794  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0096  CDS  NC_007511  102140  103630  1491  Sodium/alanine symporter  YP_370857  normal  normal  0.610074  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0097  CDS  NC_007511  104056  106134  2079  carbon starvation protein CstA  YP_370858  normal  normal  0.457953  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0098  CDS  NC_007511  106147  106353  207  hypothetical protein  YP_370859  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0099  CDS  NC_007511  106548  107168  621  hemolysin HylII family protein  YP_370860  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Bcep18194_B0100  CDS  NC_007511  107228  108634  1407  major facilitator transporter  YP_370861  normal  normal  Burkholderia sp. 383  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>