More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Met-2 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0001  tRNA-Met  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0002  tRNA-Met  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0002  tRNA-Met  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0019  tRNA-Met  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0002  tRNA-Met  97.78 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0029  tRNA-Met  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603612  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0029  tRNA-Met  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0059  tRNA-Met  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  85.92 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0030  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410556  normal  0.490456 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0050  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0022  tRNA-Met  90.2 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0158353  normal  0.287055 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1453  tRNA-Met  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0038  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0018  tRNA-Met  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0009  tRNA-Met  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0051  tRNA-Met  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14038  tRNA-Met  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.704377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07670  tRNA-Met  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0010  tRNA-Met  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0040  tRNA-Met  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  89.8 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0035  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0039  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.788311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0009  tRNA-Met  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0051  tRNA-Met  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R15  tRNA-Met  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0013  tRNA-Met  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0256009 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt49  tRNA-Met  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0053  tRNA-Met  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307129  normal  0.0211178 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0036  tRNA-Met  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.784357  normal  0.0160013 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  89.58 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0035  tRNA-Met  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.906537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0019  tRNA-Met  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0013  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0374183  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0003  tRNA-Met  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1603  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0008  tRNA-Met  90.7 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0383  tRNA-Met  88.24 
 
 		 79 bp  54  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_R0062  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0034  tRNA-Met  84.51 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_R0063  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148194  normal  0.284385 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0560  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0015  tRNA-Met  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0026  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0008  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100905  hitchhiker  0.00491713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>