More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_R0008 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_R0008  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100905  hitchhiker  0.00491713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0383  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  153  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1603  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0560  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  97.18 
 
 		 74 bp  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0068  tRNA-Met  97.18 
 
 		 74 bp  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  97.18 
 
 		 74 bp  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0066  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0931764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0039  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0049  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0058  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0349408  decreased coverage  0.0094622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  94.37 
 
 		 74 bp  109  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>