More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0038 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0038  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0002  tRNA-Met  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.594163  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  95.95 
 
 		 79 bp  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07715  tRNA-Met  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.461139  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  93.75 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  96.3 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0053  tRNA-Met  96.23 
 
 		 72 bp  89.7  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0633  tRNA-Met  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000000739177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  90.14 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  92.06 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0045  tRNA-Met  90.28 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0746  tRNA-Met  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0034  tRNA-Met  95.83 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  90.28 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  90.28 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  90.28 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26130  tRNA-Met  92.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0018  tRNA-Met  95.74 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  88.73 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  90.48 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0753  tRNA-Met  90.14 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0540995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0030  tRNA-Met  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410556  normal  0.490456 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0026  tRNA-Met  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000815309  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  92.86 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  88.89 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  88.89 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  88.89 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  88.89 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  88.89 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  95.35 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.16 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-3  tRNA-Met  92.16 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000174152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.16 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  92.16 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.16 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.16 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  92.16 
 
 		 80 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000104946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  92.16 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  92.16 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  92.16 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  92.16 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0062  tRNA-Met  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0560501  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  97.44 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  92.16 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>