More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_R0005 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0053  tRNA-Met  97.26 
 
 		 72 bp  123  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.74 
 
 		 80 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.74 
 
 		 80 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.74 
 
 		 80 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  96.92 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0003  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0223244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0071  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0026  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0016  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0056  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0075  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0010  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0064  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0079  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0084  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0109  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000630943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0031  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0046  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0024  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230769 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0043  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0069  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00149713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0048  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.816962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0058  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.547375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0040  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0057  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762222  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0018  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>