More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_R0003 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_R0003  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0019  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0001  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0002  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0002  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0002  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0059  tRNA-Met  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0029  tRNA-Met  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603612  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  94.44 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0029  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0051  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0052  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.902877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0053  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0054  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.871356 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0055  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0056  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.880459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0057  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.88568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  92.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0021  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0023  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R15  tRNA-Met  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0018  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.721782  hitchhiker  0.000298186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0022  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0045  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  92.59 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  89.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>