More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_R0029 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603612  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0019  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904201 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0002  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0001  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0002  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0002  tRNA-Met  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0059  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0056  tRNA-Met  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0029  tRNA-Met  98.28 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0051  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0052  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.902877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0053  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0054  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.871356 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0055  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0056  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.880459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0057  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.88568 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0003  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138576  hitchhiker  0.000360395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0003  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_R0062  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_R0063  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148194  normal  0.284385 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_R0061  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  92.86 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t53  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t54  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  90.91 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0068  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.516961 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  92.19 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0049  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00365867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0049  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000106187  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  92.19 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  92.19 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  92.19 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0003  tRNA-Met  94.55 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  92.06 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>