More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_R0029 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.42 
 
 		 80 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  93.42 
 
 		 79 bp  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0029  tRNA-Met  98.28 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603612  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0012  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0019  tRNA-Met  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0059  tRNA-Met  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0001  tRNA-Met  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0002  tRNA-Met  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0002  tRNA-Met  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0002  tRNA-Met  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  92.11 
 
 		 80 bp  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  92.11 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  92.11 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0003  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0041  tRNA-Met  92.11 
 
 		 75 bp  97.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_R0061  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_R0063  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148194  normal  0.284385 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_R0062  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0003  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138576  hitchhiker  0.000360395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>