More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_R15 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_R15  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0054  tRNA-Met  93.42 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  92.54 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0006  tRNA-Met  96.3 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0059  tRNA-Met  97.96 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0045  tRNA-Met  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0041  tRNA-Met  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000116747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0093  tRNA-Met  91.04 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.482828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0035  tRNA-Met  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0029  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0030  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0064  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2163  tRNA-Met  89.33 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.214808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0034  tRNA-Met  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168709  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0002  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0049  tRNA-Met  89.33 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256943  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2250  tRNA-Met  89.33 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0001  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  89.55 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0019  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904201 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0002  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0002  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0029  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603612  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0003  tRNA-Met  93.1 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0051  tRNA-Met  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.920711 
 
 
-
 
NC_002950  PGt49  tRNA-Met  89.04 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  92.45 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0068  tRNA-Met  92.45 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  92.45 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0030  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410556  normal  0.490456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0003  tRNA-Met  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_R0061  tRNA-Met  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_R0063  tRNA-Met  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148194  normal  0.284385 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_R0062  tRNA-Met  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.340081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0003  tRNA-Met  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138576  hitchhiker  0.000360395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>