More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0025 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0068  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0039  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0049  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0058  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0349408  decreased coverage  0.0094622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1603  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0560  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13960  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19530  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0030  tRNA-Met  94.74 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0022  tRNA-Met  95.83 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14980  tRNA-Met  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.014365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.51 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0007  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0038  tRNA-Met  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21039  normal  0.321257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>