More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0010 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0383  tRNA-Met  97.37 
 
 		 79 bp  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0008  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100905  hitchhiker  0.00491713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0030  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.299355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0056  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.401301  normal  0.029437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0070  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.770554  normal  0.621408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0019  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0040  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.321259 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0058  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0349408  decreased coverage  0.0094622 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0026  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0305546  normal  0.617665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0025  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000322634  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3081  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0039  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0049  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0052  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2238  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0060  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  97.22 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0054  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0068  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0078  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0035  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0007  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0038  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21039  normal  0.321257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>